【摘 要】
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目的:肺癌的发病率在全球名列前茅,并且它的死亡率在中国乃至全球癌症患者中首当其冲。其中患非小细胞肺癌的病人占肺癌患者总数的八成以上。近几十年来内外科治疗非小细胞肺癌的手段不断发展,形成了以微创外科手术治疗为主的治疗体系,但总体疗效仍不理想。人类癌症的发生和进展与免疫功能相关,但与免疫相关的差异表达基因在肺癌组织及癌旁组织中的特性和意义尚不清楚。本实验旨在探讨免疫相关差异基因对非小细胞肺癌预后的影响
【基金项目】
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辽宁省重点研发计划指导计划项目（No.2017225035）；
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目的:肺癌的发病率在全球名列前茅,并且它的死亡率在中国乃至全球癌症患者中首当其冲。其中患非小细胞肺癌的病人占肺癌患者总数的八成以上。近几十年来内外科治疗非小细胞肺癌的手段不断发展,形成了以微创外科手术治疗为主的治疗体系,但总体疗效仍不理想。人类癌症的发生和进展与免疫功能相关,但与免疫相关的差异表达基因在肺癌组织及癌旁组织中的特性和意义尚不清楚。本实验旨在探讨免疫相关差异基因对非小细胞肺癌预后的影响。研究方法:研究的第一部分:找出非小细胞肺癌患者肿瘤组织和癌旁组织中免疫相关差异表达基因。实验中将在癌症基因图谱计划（TCGA）获取包括转录组表达和临床特征在内的多个数据后,整合肺腺癌及肺鳞癌信息,利用生物信息学工具中的“edge R”软件包,从非小细胞肺癌肿瘤组织和癌旁组织中筛选出表达出现明显差异的基因,并对这些基因与免疫功能的相关性做鉴定。研究的第二部分:建立能够预测非小细胞肺癌预后的风险模型并验证。实验中通过“survival”包、“survival ROC”包和“rms”包对鉴定出的免疫相关差异基因进行统计学两步分析:先进行单因素分析后,利用得到的结果再进行多因素Cox回归分析建立预后风险模型。利用基因表达数据库（GEO）中的转录组表达及临床特征数据对模型进行检验。研究的第三部分:探讨免疫相关差异基因在非小细胞肺癌发生发展中的作用。实验中借助“cluster Profiler”软件包对鉴定出的具有免疫相关性的差异表达基因进行GO分析、KEGG分析。除此之外,我们还借助网络分析工具c Bio Portal分析了NSCLC中这些基因的体细胞基因组突变和拷贝数改变。应用“GSVA”包进行基因集变异分析探讨不同种类的通路差异。结果:非小细胞肺癌患者肿瘤组织和癌旁组织中免疫相关差异表达基因:“edge R”包在TCGA样本的肿瘤组织和癌旁组织中确定有4549个差异表达的基因,其中336个基因与免疫相关。非小细胞肺癌预后的风险模型:剔除删失数据,本研究共纳入909例非小细胞肺癌患者的转录组表达数据及临床特征数据,单因素分析产生31个有意义的基因被用于多因素Cox回归分析,得到一个由CRHR2、LIFR、UMODL1、FGA、LCN15、PTX3、SEMA4B组成的预后风险模型。经GEO数据库中数据验证模型可靠。免疫相关差异基因在非小细胞肺癌发生发展中造成的影响:这些免疫相关差异基因被富集到不同信号通路之中,包括RAS信号通路和RAP1信号通路,以及体液免疫反应等。CRHR2、LIFR和UMODL1为保护基因,FGA、LCN15、PTX3和SEMA4B为危险基因且均为影响非小细胞肺癌预后的独立因素。GSVA分析结果显示在相关的免疫特征方面,它们的表达差异导致细胞凋亡异常和细胞周期不规则,从而产生非小细胞肺癌的启动和进展。结论:1.CRHR2、LIFR、UMODL1、FGA、LCN15、PTX3、SEMA4B等336个基因是非小细胞肺癌中免疫相关差异基因。2.CRHR2、LIFR、UMODL1、FGA、LCN15、PTX3、SEMA4B建立的预后风险模型可以对非小细胞肺癌患者的生存率做出可靠预测。3.CRHR2、LIFR和UMODL1为保护基因,FGA、LCN15、PTX3和SEMA4B为危险基因且均为影响非小细胞肺癌预后的独立因素。
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目的:分析小分子酪氨酸激酶抑制剂联合PD-1单抗治疗晚期消化系统恶性肿瘤的疗效及安全性。研究方法:回顾性收集中国医科大学附属第一医院肿瘤内科2019年3月至2021年2月应用小分子酪氨酸激酶抑制剂（tyrosine kinase inhibitors,TKI）联合PD-1单抗治疗的晚期消化系统恶性肿瘤患者的资料,收集患者的用药时间及用药剂量,用药后的疗效及不良反应,比较不同肿瘤生长速率（tumor
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