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甜玉米(ZeamaysL.saccharataSturt)为玉米属(ZeamaysL.)的一个亚种，是普通玉米的一种胚乳突变体。甜玉米起源于美洲，我国于上个世纪60年代才开始甜玉米引种。资源的相对匮乏已经成为束缚我国甜玉米育种的一大瓶颈。因此，在不断收集国内外新的甜玉米种质资源的同时，建立现有资源的形态和分子标记数据库，进一步对资源进行遗传多样性分析，对于指导甜玉米育种具有重要意义。
本研究以广东省农业科学院作物研究所甜玉米种质资源库中的347份资源为材料，首先根据重要农艺性状、产量性状和品质性状等对甜玉米种质进行总体评价和分析；其次，用SSR标记对资源进行亲缘关系的划分，指导甜玉米杂交配组工作。同时，在此基础上筛选出一组核心引物，构建了部分重点材料的SSR指纹图谱，为这些重要甜玉米资源的鉴定在分子水平上提供参考依据。
本研究的主要结论如下：
1、单性状分级统计表明，347份甜玉米种质资源中，43-47天内吐丝的资源占总资源数的8.65％；果皮厚度评为“薄”和“较薄”的资源占总资源的33％；甜度为“甜”和“很甜”的资源占45.24％。该研究结果提示，进一步引进或培育早熟以及果皮薄的遗传种质仍然是甜玉米资源库建设的重要任务。
2、主要食用品质性状的相关分析表明，甜度、爽脆度与皮渣滤和果皮厚度之间达到了极显著正相关水平(相关分析时，甜度越高赋值越大；果皮越薄，赋值越大)。在果皮薄的资源中，单穗重、行粒数等均较小，产量上有待进一步改良或引进。早、晚熟资源在产量和甜度上没有较大的差异。晚熟资源的果皮相对早熟较薄，皮渣率少。
3、从122对SSR标记中筛选出57对稳定性好的SSR标记，对347份材料进行亲缘关系分析，共检测到272个等位基因，平均每个标记为4.77个。每个标记的PIC平均值为0.4893。以8.0为阈值，将347份资源划分为49大类，第1类中的资源约占1/3，说明资源库中大部分材料亲缘关系较近。
4、筛选出12对核心引物(编号为001-012)，构建了167份重要甜玉米资源的SSR指纹图谱。