基于SSAP和SSR分子标记的秋子梨和砂梨品种的起源研究

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一般认为,梨属(Pyrus L.)植物起源于第三纪或更早期的中国西南部山区。地理上分为东方梨(Oriental pears)和西方梨(Occidental pears)两大群体。东方梨栽培系统主要有:砂梨系统(Chinese Sand pear)、白梨系统(Chinese Whitepear)、秋子梨系统(Ussurian pear)、新疆梨系统(Xinjiang pear)和日本梨系统(Japanese pear)。前人研究发现,砂梨和白梨品种拥有相同的基因库组成,属于同一种质;新疆梨遗传背景较为复杂,可能为东方梨和西方梨的杂交种;对于日本梨的起源问题,不同的学者观点不一。而原产中国的秋子梨品种的起源,至今尚不清楚。本实验室之前的研究发现,栽培秋子梨的基因库组成中含有一半的白梨/砂梨基因库,同时猜测另一半来源于野生秋子梨,但样品中缺乏秋子梨野生种。另外还发现,川梨在砂梨品种起源中存在基因渐渗现象。本试验在前人研究的基础上,利用SSR分子标记和基于反转录转座子的SSAP分子标记,对秋子梨品种起源和川梨在白梨/砂梨品种起源中的作用进行分析,主要结果为:  利用SSAP分子标记,对92个梨属植物样品进行了分析。结果共产生1143个条带,其中多样性条带数为871,占比为76.2%,显示出很好的多态性。系统树和STRUCTURE结果均显示,梨属植物分为东方梨和西方梨两个群体。东方梨群体中,当相似系数约为0.56时,中国白梨和砂梨在系统树中混杂在一个大组,大多数秋子梨野生种和品种聚在一起形成另外一个大组。而在相似系数约为0.61时,野生秋子梨和栽培秋子梨相互分离,且‘锦西山梨’、‘青面’、‘软儿梨’三个秋子梨品种分散在白梨/砂梨组中。另外,K=3时的STRUCTURE柱状图显示栽培秋子梨的基因库包含两部分:一部分来源于野生秋子梨,另一部分来源于白梨/砂梨品种。  使用前人开发的16对SSR分子标记,对83个中国白梨或砂梨、野生秋子梨和栽培秋子梨之间的遗传关系进行分析研究。16对引物产生的平均等位基因数(na)为13.63,平均有效等位基因数(ne)为5.29,期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)平均值分别为0.72、0.534,香农指数(I)和PIC平均值分别为1.812、0.752。NJ邻接树结果显示,样品被分为两个大组。在第一个大组中,所有的野生秋子梨和大部分秋子梨品种分别聚在不同的两个亚组中。而其他的秋子梨品种分别与白梨/砂桑品种相互混合,形成不同的几个亚组,剩余几个亚组基本由白梨和砂梨混合聚类组成。K=2时,STRUCTURE结果显示出野生秋子梨和栽培秋子梨不同的遗传结构。野生秋子梨由较为单纯的基因库组成,白梨/砂梨主要由另一种基因库组成。而秋子梨品种则混合了野生秋子梨和白梨/砂梨的基因库组成,其中多数品种含有较高比例的野生秋子梨的基因库。  选用包含川梨、白梨或砂梨品种等在内的92个梨属植物样品,基于反转录转座子开发的SSAP分子标记,对川梨在砂梨品种起源中的基因渐渗问题进行研究。系统发育树和STRUCTURE结果均显示东方梨和西方梨不同的遗传结构。东方梨群体中,川梨单独聚成一组,和其他群体相互区别。当K=3时,所有样品由3个基因库组成。其中,川梨遗传背景较为单纯,主要由单一基因库组成。而白梨/砂梨的主要基因库为另一种,且包含有不同比例的川梨基因库组成,该结果表明川梨在一定程度上参与了白梨/砂梨品种的起源。同时,对不同地理区域的群体(P1-P9)遗传距离的计算可知,川梨对白梨/砂梨的基因渐渗现象由云贵川地区自西向东传播,并逐渐减弱。  本研究利用SSAP和SSR分子标记,从不同的角度阐明了秋子梨品种的杂交起源、分析了川梨在砂梨品种起源过程中的作用。试验结果为品种培育和改良提供了相应的理论依据,但仍然存在采集样品范围较小的问题,需要在今后的研究中扩大样品特别是秋子梨和川梨的采集范围。
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