违法所得没收程序作为一项特别程序,当前实践中适用较少,理论研究也多专注于立法建议。通过对我国违法所得没收程序的适用现状进行考察和分析,可以发现其在实际运用中存在诸多亟待解决的问题。例如逃匿型违法所得案件适用率低;没收方式存在分歧;证明标准的适用存在分歧;利害关系人权利保障不到位以及与部分案件程序适用不合理的问题。因此,我们需要结合立法以及适用情况对违法所得程序的相关规定进行完善。首先,优化逃匿型案件的启动条件,其中包括取消通缉期限和细化重大案件的认定标准,使得更多逃匿型案件能够纳入违法所得没收程序的适用范围;其次,建立和完善价值没收原则,在被告人的违法所得灭失时,能够在其合法财产中进行价值没收,以补偿给国家利益造成的损失;再次,明确违法所得没收程序的证明标准,根据检察机关和利害关系人证明能力的强弱差别,确立差异化证明标准体系;然后,通过扩大知情权范围、赋予获得利害关系人法律援助的权利、二审一律坚持开庭审理等方式进一步加强对利害关系人的权利保障;最后,在违法所得没收程序与刑事缺席审判程序适用重合的范围内,明确优先适用违法所得没收程序的情况。以此完善我国的违法所得没收程序,提高该程序实践中的适用率,最大程度地发挥该程序的追赃作用。