本研究主要对2009年6～12月在我国湖北、浙江、广东采集的108人份发热患者的咽拭子样本，通过荧光定量RT-PCR、MDCK细胞培养分离、全基因组序列测定方法进行病毒分离鉴定，获得了24株新甲型H1N1流感毒株，8株季节性甲型流感毒株。本研究对24株新甲型H1N1流感毒进行了基因组序列相似性比较、关键位点比对和进化分析，结果显示：1)该24株病毒与A/Mexico/4486/2009(H1N1)，A/California/04/2009(H1N1)等流行株的相似性为95％～99%：2)进化分析表明其为三联重排病毒：其中HA、NP、NS起源于经典的猪流感病毒；NA、MP起源于禽源猪流感病毒；PB2、PA起源于禽流感病毒；PB1起源于人流感病毒。3)关键位点比对结果显示：PB2的627位为E(谷氨酸)，保留了禽源病毒的特性；M2的32位为N(天冬酰胺)，表明病毒对金刚烷胺类抗病毒药物具有抗性；NA基因关键位点无突变，说明病毒对神经氨酸酶抑制剂敏感；23株甲型H1N1流感病毒的HA基因关键位点无突变，仅一株分离于甲流重症死亡病例的毒株(A/2hejiang/89/2009(H1N1)在HA基因受体结合位点发生D225G突变。唾液酸α-2，6半乳糖(SAα-2，6Gal)受体在人的上呼吸道广泛存在。反之，唾液酸α-2，3半乳糖(SAα-2，3Gal)受体主要分布在下呼吸道系统。因此D225G的突变可能导致病毒致病性改变，引起患者下呼吸道(肺组织)感染。　　 为证实D225G突变株的致病性变化，我们进行了小鼠感染实验。致病性实验结果表明，突变株与非突变株实验组相比较，突变株感染后4～6d小鼠体重下降明显，P＜0.001，差异极显著；突变株感染后3d、6d、9d小鼠肺组织中病毒拷贝数均明显高于非突变株实验小鼠，P＜0.05，差异显著。表明D225G突变所致的毒株致病性增强，可能是引起患者重症肺部感染并导致死亡的主要原因。