黄皮遗传多样性的RAPD分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pengk33
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黄皮属(Clausena Burm)植物种类较多,全世界约30余个种,其中11个种原产中国。黄皮为中国种,其栽培品种主要有大鸡心、选种大鸡心、长鸡心、郁南无核、独核甜、岐山甜、从城甜、红嘴鸡心、白糖鸡心、龙山无核、广西无核等。目前各地栽培的黄皮品种颇多,但不少同物异名或同名异物,由于地理分布的重叠和种类间的自然杂交,产生了多种中间过渡类型,使其种内品种的界线不清晰。本研究以89份黄皮种质为试验材料,利用RAPD技术对不同的黄皮种质进行分子水平的比较分析,通过实验设计及相应的统计分析做出聚类分析图,并应用流式细胞仪对部分种质进行染色体倍性分析,研究黄皮种质的遗传多样性和各种质相互之间的亲缘关系,为黄皮种质资源的起源和分类提供科学依据,也为今后更好地服务于黄皮遗传育种、优良品种鉴定以及黄皮种质资源保存等方面提供理论依据。主要研究结果如下:1、经过流式细胞仪的检测,白糖甜黄皮、早熟甜黄皮、早熟黄糖黄皮、鹰嘴黄皮、独核黄皮Ⅰ、独核黄皮Ⅱ、小果长鸡心黄皮均为二倍体,而广西无核黄皮、郁南无核黄皮为三倍体。2、利用改良的CTAB法提取DNA,质量和浓度采用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计测定。OD260/OD280在1.7-1.9之间,较纯,可用于RAPD-PCR扩增。3、确定了黄皮的RAPD反应体系为:1.0 U Taq DNA聚合酶、2.5 mmol/L Mg2+、0.5μmol/L随机引物、50 ng模板DNA、0.20 mmol/L dNTPs,剩下的用ddH2O来补充。确定了适合黄皮的RAPD反应扩增程序为:94℃预变性3 min,94℃变性45 s,36℃退火45 s,72℃延伸1 min,38个循环;72℃后延伸7 min,4℃保存。4、从80个10碱基随机引物中筛选出18个扩增谱带清晰且稳定的引物,用这些引物对89份种质进行扩增,均具有多态性,共扩增出156条带,其中102条具有多态性,多态性比例为65.4%。Shannon多样性信息指数(Ⅰ)为0.6677,基因多样性(Ht)为0.4751。5、对89份黄皮种质进行了RAPD扩增,根据相似系数进行了聚类分析,依相似系数0.821的水平,可以将其分为4大类,具体情况如下:Ⅰ类:早熟甜黄皮、迟熟甜黄皮、广西无核、广西杂交黄皮、大叶长鸡心等,主要是广东、广西的54份种质;Ⅱ类:琼1号~14号黄皮、揭阳无核、龙山无核、广西圆皮、阳山鸡心,主要是海南省种质;Ⅲ类:郁南无核Ⅰ、从城黄皮Ⅲ、大鸡心Ⅰ、选种大鸡心、鸡心黄皮Ⅳ、广西小果鸡心、郁南无核Ⅱ、广西鸡心、从城黄皮Ⅰ、从城黄皮Ⅱ;Ⅳ类:鸡心黄皮Ⅵ、酸黄皮、鸡心黄皮Ⅷ、鸡心黄皮Ⅶ、塔下酸黄皮。
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