金水丝羽乌骨鸡资源群体的构建和三个基因的SNPs检测及其与羽色性状的连锁分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hikerqw2
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乌骨鸡是一种珍贵的中国地方鸡品种,乌骨鸡的营养及药用价值与其体内所含的黑色素有关,其药用价值及独特的滋补作用享誉中外。研究表明,具有分泌黑色素的能力的在黑羽乌骨鸡和白羽乌骨鸡都有,且在皮肤、肌肉和骨骼中黑色素都能够沉积,但是显然黑色素难以迁移沉积到白羽乌骨鸡的羽毛中。研究白羽乌骨鸡和黑羽乌骨鸡中色素沉积差异产生的分子调控机制,并努力阐明黑色素沉积的分子调控机理具有重要的理论意义。本研究利用金水乌鸡黑羽丝毛系和白羽丝毛系作为亲本进行正反交,得到F1代个体后进行F1横交生产F2代分离群体,性状实现分离,构建了金水丝羽乌骨鸡资源群体,在此资源群体中结合鸡全基因组研究现状,利用候选基因法和连锁分析法定位控制这·相对性状的基因座。依据这-实验设计和设想,本研究顺利开展了并完成了下列实验:1.亲本采用了正反交实验:采用3只黑羽母鸡与3只白羽公鸡进行反交,3只黑羽公鸡与3只白羽母鸡进行正交,共得到F1代仔鸡29只;F1代出现黑羽和花羽两种羽色。2.F1代横交生产F2分离群体:利用正交组F1代的相同羽色和不同羽色个体间交配(黑羽公鸡与黑羽母鸡交配、花羽公鸡与花羽母鸡交配、黑羽公鸡与花羽母鸡交配、花羽公鸡与黑羽母鸡交配);利用反交组F1代黑羽公鸡分别与正交组黑羽母鸡、花羽母鸡进行交配;现已得到121只F2代仔鸡,其中黑羽43只,白羽21只,花羽57只;亲代、F1代、F2代共计147只。3.采用PCR-RFLP发现了MCIR基因外显子上的2个多态位点和EDNRB2基因第一和第九外显子上的5个多态位点,分析了全部多态位点在不同羽色中的基因型频率和基因频率;并利用CRIMAP软件分析EDNRB2的5个SNP位点与羽色之间的连锁关系;构建了EDNRB2基因的单倍型块;并进行卡方检验分析SNP位点与羽色的关系。4.建立了隐性白羽基因的PCR检测方法,TYR基因第四内含子有逆转录病毒插入导致了隐性白羽等位基因的产生,实验结果显示亲本中黑羽是无逆转录病毒插入的,白羽全部为有逆转录病毒插入。
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