T--box基因家族的进化分析

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自1927年T (Brachyury)基因被首次发现以来,越来越多的具有同源DNA结合结构域的基因被归入T-box基因家族。大量的研究提示,T-box基因在许多物种的发育中起着关键的作用,其突变将导致多种疾病。如在人类中,Tbx3和Tbx5突变可分别导致Ulnar-Mammary综合征和心-手综合征。所有的T-box转录因子均包含一个特征结构,即在N端有一个由180个氨基酸残基组成的DNA结合域,称为T-box区。该区域的DNA序列高度保守,而各成员之间的其余序列则并未发现相似性。研究者对T-box家族成员之间的同源性进行了探索,但尚未对来自不同物种的T-box基因进行系统分析。此外,最新发现的T-box成员未被纳入这类研究,因此有必要对T-box家族的进化进行更为系统的起源分析。本研究尝试用比较基因组学方法分析人类以及多个其他物种的T-box家族基因的序列一致性,从而揭示其间在进化上的联系,具体涉及T-box家族基因的古老性分析、即确定其中最原始的版本,此外将探讨该家族基因随进化所发生的变化。本研究通过生物信息学方法发现了T-box基因进化过程中的重要物种,并推测了其中的位点变化。本研究不仅将有助于帮助研究者从宏观上了解T-box家族成员的亲缘关系和演化史,还可能从表达模式以及疾病表型的分析中发现基因与发育的重要规律。此外,通过对T-box基因家族相关数据和软件比对结果进行整理,本研究还利用MyEclipse和Tomcat构建了JSP平台,并用MySQL数据库实现了数据存储以及信息交互,对分析结果和最新的发现进行展示。这也是首次尝试对T-box家族进行系统的分析和可视化处理,具有较强的实用价值。
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