彩色马蹄莲(Zantedeschia hybrida)是具有很好观赏性的球根花卉,深受国内外消费者所喜爱,拥有“彩色百合”的美称。现在市场上流行的彩色马蹄莲多为新西兰、荷兰、美国等国家培育的品种。与这些国家相比,我国彩色马蹄莲新品种培育工作起步晚,还存在很多问题亟待解决,育种研究工作刻不容缓。所以,本研究以收集保存的138份彩色马蹄莲资源为材料,在进行性状间关联分析的基础上,分析性状与EST-SSR标记的关联性,鉴定出与彩色马蹄莲观赏性状相关联的EST-SSR标记,以期为彩色马蹄莲辅助育种与其观赏品质的改良等提供一定的理论参考,主要研究结果如下:1.观测15个表型性状,进行简单的聚类,在此基础上对性状之间的相关性进行了分析。总体来说,大多数性状与其余性状之间有一定的相关性,为性状与分子标记相关性分析提供参考。2.挑选并合成主要以二、三碱基重复motif为扩增目的序列的引物1378对;依据BSA四个DNA混池扩增显示共295对(21%)引物有多态性好的、条带清晰扩增稳定的目的条带;而后进一步随机筛选40对EST-SSR标记对138份彩色马蹄莲进行遗传多样性和群体结构分析,40对引物共检测出125个等位基因,杂合度从0.01到0.95,平均为0.56,PIC值从0.15到0.75,平均值为0.43,表明本研究获得的位点的遗传多样性比较丰富。3.利用TASSEL软件分析上述标记与株高、叶长、雌蕊长、佛焰苞长、叶片绿色程度等15个性状的位点组合。在P<0.05条件下共检测到45个关联位点,与佛焰苞喉斑相关联的位点数最多为10个,与株高、佛焰苞宽、佛焰苞高及佛焰苞内侧主色相关联的位点最少为1个。存在同一位点与多个性状关联的情况,Call Re458与叶长、雄蕊总长、佛焰苞长、佛焰苞宽相关联,Zacp192与叶长、叶柄长和雄蕊总长相关联。在P<0.001条件下只检测到2个关联位点,而且都与佛焰苞喉斑这个性状相关。