在鳞翅目中，弄蝶的分类地位和系统发生关系始终存在着争议。由于弄蝶与其他蝶类在形态学和行为学上的明显区别，比如弄蝶矮胖的体型、钩状的触角，快速的跳跃飞行等，弄蝶通常被人们从真蝶类中分离出来作为单独的一个类群。本文利用long PCR和walking-primer测得梳翅弄蝶、绿弄蝶和直纹稻弄蝶的线粒体基因组全序列，并初步比较分析了其基因组成和结构特点。结果显示：梳翅弄蝶、绿弄蝶和直纹稻弄蝶线粒体基因组长度分别为15468bp、15272bp和15441bp，都包括13个蛋白质编码基因（ATP6，ATP8，COI-III，ND1-6，ND4L，Cytb）、22个tRNA基因、2个rRNA基因（16S和12S）以及非编码的控制区；此外，梳翅弄蝶线粒体基因组中多出一个转运缺臂丝氨酸tRNA和转运亮氨酸tRNA，而绿弄蝶和直纹稻弄蝶线粒体基因组的基因排列顺序和方向与其他鳞翅目昆虫相一致，未出现基因重排现象。梳翅弄蝶线粒体基因组共包含14个基因间隔区，总长度为179bp，间隔长度1-61bp，最大间隔在tRNAGln与ND2基因之间；基因间共存在13处重叠，总长度为37bp，重叠碱基数1-7bp。lrRNA和srRNA基因长度分别为1343bp和774bp；除tRNA^Ser（AGN）缺少二氢尿嘧啶臂，在相应的位置上只形成一个简单环外，其余的tRNA基因都能形成典型的三叶草结构。包括COI （起始密码子为ATT）在内的13个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子；COII基因的终止密码子为不完全T，ND2和ND3基因为TAG，其余基因都以TAA为终止密码子。A+T丰富区全长为429bp，A+T含量高达88.1%，其中存在2段类似微卫星的重复序列（AT）₅和（TA）₉。绿弄蝶线粒体基因组共包含19个基因间隔区，总长度为269bp，间隔长度1-88bp，最大间隔在tRNA^Gln与ND2基因之间；基因间共存在7处重叠，总长度为22bp，重叠碱基数1-8bp。lrRNA和srRNA基因长度分别为1355bp和777bp。除tRNA^Ser（AGN）缺少二氢尿嘧啶臂，在相应的位置上只形成一个简单环外，其余的tRNA基因都能形成典型的三叶草结构。除去COI基因外的其余12个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子；COI、ND2、ND4和ND5基因的终止密码子为不完全T，ND3基因为TAG，其余基因都以TAA为终止密码子。A+T丰富区全长为293bp，A+T含量高达92.2%，其中存在类似微卫星的重复序列：（AT）10、（TA）₂GA（TA）₉、（AT）₆、（TA）₇、 poly-A和poly-T等。直纹稻弄蝶线粒体基因组共包含15个基因间隔区，总长度为269bp，间隔长度1-99bp，最大间隔在tRNA^Gln与ND2基因之间；基因间共存在9处重叠，总长度为27bp，重叠碱基数1-8bp。lrRNA和srRNA基因长度分别为1368bp和778bp；除tRNA^Ser（AGN）缺少二氢尿嘧啶臂（DHU stem），在相应的位置上只形成一个简单环外，其余的tRNA基因都能形成典型的三叶草结构。除COI基因的起始密码子分别为CGA外，其余的12个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子；ND2、COI、COII、ND4和ND5基因的终止密码子为不完全T，其余基因都以TAA为终止密码子。A+T丰富区全长为411bp，A+T含量高达90.8%，其中存在类似微卫星的重复序列（AC）₂（AT）₅、（TA）₅（AT）₂和（AT）₁₁（GT）₄等。为了探讨鳞翅目部分物种的系统分类地位和系统发生关系，本文以茶小卷叶蛾（Adoxophyes honmai）为外类群，基于线粒体基因组13个蛋白质编码基因全序列数据，使用最大似然法（maximum-likelihood, ML）和贝叶斯推论法（bayesian inference, BI）构建了16种代表性蝶类物种的系统发生树。结果显示：本研究中的弄蝶科3种蝶类聚为一支，弄蝶支先与蛱蝶科（包括苎麻珍蝶、斐豹蛱蝶、大卫绢蛱蝶、大紫蛱蝶、仁眼蝶、残颚线蛱蝶、柳紫闪蛱蝶）和粉蝶科（菜粉蝶、黑纹粉蝶、优越斑粉蝶）灰蝶科（朝灰蝶）聚成的一支聚合，再与凤蝶科（包括宽尾凤蝶、金斑喙凤蝶、红珠绢蝶）聚在一起。即弄蝶科位于凤蝶总科内部，与（（粉蝶科+灰蝶科）+蛱蝶科）形成姊妹群。