明代学术史的书写，并不仅仅是后人对历史的书写，更是历史对自身的反思。明末清初，诸儒们一方面对明代学术进行清算，另一方面，也有黄宗羲因之而起的制约皇权说。而近代以来，西学东渐，传统学术范式面临转型，许多知识分子以哲学的方式对明代学术进行诠释。在新的框架下，赋予晚明思想“启蒙”的地位。同时世有史家以“辨章学术，考镜源流”为志，重新梳理明代思想，产生了哲学与史学二流中分的局面。笔者则继史家之笔，欲重述明初思想史。 元末明初，士大夫多不知大体，昧于春秋大义，故往往视旧朝为正统，新朝为叛逆。故有方孝孺力持正统之论，恢复理学之旧观。然不久靖难祸起，燕王以边境藩王，拥兵篡夺帝位，方孝孺竟以身殉道，捍卫天理。成祖即位后，即以旧臣修纂《永乐大典》和《四书》、《五经》、《性理》三部大全，目的在于彰显文治，证明道统与正统为一。多数士大夫则不为其动，或于朝廷力持清议，或于民间讲道守身，皆以天理为依归。后有学者，以此为归，躬身践履，以成心学。心学为何，良知而已，知善知恶，即为天理。 晚明诸儒，则以入朝为荣，先为世宗，主持议礼，后请神宗从祀阳明。从朝廷转向民间，从民间重归朝廷，此为一轮回。虽明亡清灭，轮回也未结束。只是知识分子昧于知古，无从知今罢了。既然现在仍在“天理”与“良知”的轮回中，我们能从明代历史，获得什么教益呢?历史仍未结束，大地知道答案!