胡麻枯萎病是一种由尖孢镰刀菌胡麻专化型引起的严重危害胡麻产量的土传真菌性维管束病害。本研究组在患病胡麻植株的根围土壤中分离得到了一株对尖孢镰刀菌胡麻专化型具有明显抑制效果的萎缩芽孢杆菌SF1。本论文运用转录组测序技术,分别以尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株和与生防菌SF1共培养的尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株为研究对象,对尖孢镰刀菌胡麻专化型菌株的转录组学进行了测定并对测序数据进行分析,得到以下结果:1、首先对SF1发酵液及其无细胞滤液对G56的抑菌效果进行了比较,之后绘制了不同发酵时间SF1发酵液对G56的抑菌率变化曲线,从而确定了本次实验中实验组的处理方法。2、以G56作为对照组,与SF1发酵液进行共培养后的G56作为实验组,对G56进行转录组测序,发现:（1）可变剪切事件中属于SE类型的AS事件数量最多;A5SS、A3SS、RI三类AS事件数量相当,明显少于SE类型AS事件;同时,并无MXE类型AS事件发生。（2）G56 组、SF1₂4h 组、SF1₄8h 组分别有 42.20%、41.25%、41.51%的基因不表达,对于表达的基因FPKM值处于16～60范围内的基因数量最多,之后依次是FPKM值处于3～15、>60、1～3范围内的基因。（3）SF1₂4hvsG56发现690个上调基因,581个基因下调。SF1₄8hvs G56发现584个上调基因,595个下调基因;其中882个在SF1₂4hvsG56与SF1₄8h vs G56均有差异表达。（4）SF1₂4hvsG56的全部1271个差异表达基因被注释到30个GOTerm和55个涉及下调基因的KEGG通路,以及66个涉及上调基因的KEGG通路。（5）SF1₄8h vs G56的全部1179个差异表达基因被注释到25个GO Term和52个涉及下调基因的KEGG通路,以及65个涉及上调基因的KEGG通路。