耐喹诺酮类药物鲍曼不动杆菌PMQR基因及gyrA、parC基因突变的研究

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背景:鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii,Ab)是一种非发酵,革兰氏阴性,无动力,氧化酶阴性杆菌,其广泛分布于水、土壤、医院环境和健康人体的皮肤表面,对湿热、紫外线、化学消毒剂有较强抵抗力,可长期存活,属机会致病菌。近年来,分离率逐年上升,在临床各种标本中,如血液,尿液、浓汁、下呼吸道分泌物以及脑脊液等都有分离出本菌的报道。根据美国院内感染检测数据(NNIS)及中国院内感染病原菌耐药监测等资料显示,鲍曼不动杆菌目前已成为仅次于铜绿假单胞菌的一个重要的非发酵菌,在院内感染中占第四位,是医院内感染的主要致病菌。喹诺酮类抗菌药物是临床最常用的抗菌药物之一,随着广泛应用,细菌对其耐药性逐渐升高。细菌对喹诺酮类抗菌药物耐药的主要机制包括:①染色体基因突变;②外膜孔蛋白改变;③药物主动外排系统等。近年来,发现了质粒介导的喹诺酮类耐药(PMQR),使人们对细菌耐喹诺酮类药物的机制有了新的认识。   目的:⑴了解广东省人民医院院内鲍曼不动杆菌的临床分布情况和抗菌药物耐药情况。⑵了解广东省人民医院内喹诺酮耐药的鲍曼不动杆菌拓扑异构酶基因gyrA、parC的突变情况及质粒介导的喹诺酮类耐药(PMQR)基因qnrA、qnrB、qnrS、qnrC、aac(6)-Ib—cr、qepA的流行状况。⑶探讨鲍曼不动杆菌对喹诺酮类抗菌药物耐药机制。   方法:①收集2008年1月-2009年9月期间分离自广东省人民医院的鲍曼不动杆菌,共386株。②采用VITEK-32型全自动细菌分析系统对临床收集的鲍曼不动杆菌进行重新鉴定。③采用肉汤稀释法检测鲍曼不动菌对常用抗生素的最低抑菌浓度(minimalinhibitory concentrations,MIC),所有结果的解释均执行美国临床实验室标准化协会(CLSI)2009年版的标准。④根据参考文献设计合成针对目的基因的引物序列,采用PCR技术对鲍曼不动杆菌拓扑异构酶gyrA、parC基因喹诺酮耐药决定区(QRDR)及质粒介导的喹诺酮耐药基因进行特异性扩增,并对PCR扩增产物进行DNA测序分析,与Genbank数据库比对以确定其亚型、有无突变、突变位点及由此导致的氨基酸改变。   结果:⑴细菌的临床资料显示,386株鲍曼不动杆菌有196株来自监护病房,占50.78%,呼吸道标本(痰+支气管冲洗液)占全部标本类型的82%。药敏试验结果显示,386株鲍曼不动杆菌对下列抗菌药物耐药率分别为,环丙沙星65.8%,左氧氟沙星61.4%,庆大霉素62.95%,阿米卡星1.30%,亚胺培南36.01%,头孢吡肟46.89%,头孢曲松63.73%,头孢他啶62.18%,哌拉西林/他哗巴坦38.08%,同时耐三种以上抗菌药物的多重耐药菌株占63.47%。⑵通过对环丙沙星和左氧氟沙星均耐药和敏感的鲍曼不动杆菌进行gyrA与parC基因的QRDR区PCR扩增,对产物进行测序发现25株耐药的鲍曼不动杆菌有6株gyrA基因发生了编码95位氨基酸的密码子ACT→AAT的突变,导致编码的氨基酸由苏氨酸(Thr)突变为天冬酰胺(Asn);有12株143位氨基酸由缬氨酸(Val)突变为谷氨酸(Glu),其中有6株同时发生了95位氨基酸Thr→Asn的突变。25株耐药菌株的parC基因QRDR区扩增产物全部发生了编码80位氨基酸密码子由TCG→TTG的单点突变,导致编码的氨基酸由丝氨酸(Ser)突变为亮氨酸(Leu)。两株敏感菌株未发生任何突变。⑶386株鲍曼不动杆菌通过PCR扩增及测序共有1株细菌检出qnrB基因,该菌株对环丙沙星和左氧氟沙星表现为耐药,其他质粒介导的喹诺酮耐药基因qnrA、qnrS、qnrC、aac(6)-Ib-cr和qepA均未检出。   结论:①2008年-2009年,广东省人民医院鲍曼不动杆菌耐药现象严重,大多数菌株为多重耐药菌。②gyrA和parC基因突变与鲍曼不动杆菌对喹诺酮类抗菌药物耐药密切相关。③386株鲍曼不动杆菌中检出1株菌株含有质粒介导喹诺酮耐药qnrB基因,说明在鲍曼不动杆菌中存在质粒介导喹诺酮耐药,但并不普遍。
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