胃癌是消化系统最常见的恶性肿瘤，在我国的发病率居各种恶性肿瘤之首，世界范围内胃癌的发病率和死亡率也居高不下。早期诊断和准确分型是提高胃癌总体疗效的关键和基础。本课题以115例胃癌患者的原发灶肿瘤组织作为实验组，20例健康胃黏膜组织作为对照组，利用Affymetrix Human U133Plus2.0表达谱芯片筛选出胃癌组织与正常胃黏膜差异表达基因数据，描绘胃癌特征基因表达谱，构建了加权基因共表达网络，结合病人的病理资料发现了一组可以用来区分胃癌原发灶样本和正常胃黏膜样本的分子标记物，包括：MAP3K7、MAP3K2、NF1、ARRB2、MET、PAK2、TPR、E2F3、SOS1、ATF2、PARVB、DAPK3、EPAS1、EP300、STK4、ACVR1C、FZD8、CTNNB1、PTPRR及MAP3K13，这组基因主要作用于MAPK信号通路。以及在胃癌早期表达量显著提高的分子标记物，包括：ILK、HSPG2、FYN、CAV1、TNC、ZAK、MYLK、FLNA、MYL9及MMP2，这组基因的生物学功能主要与调节蛋白激酶活性相关。同时发现可以补充病理TNM分期的分子标记物，包括：JAKMIP3、MAGI2、SYNE1、DCX、CLUL1、ZNF578、MYOZ2及PGR，这组基因的表达值与患者五年生存率成反比，即基因表达值越高，患者五年生存率越低。此外，结果显示Focal Adhesion通路相关基因的激活可以促进胃癌的发生和发展。本课题通过系统生物学方法研究胃癌进展中基因表达谱的变化，揭示关键分子通路，预测新的分子标记物，寻找潜在治疗靶点，为胃癌的机理研究提供新的思路，为临床诊断和治疗提供借鉴。