驯鹿β-防御素-1(reBD-1)全长cDNA的克隆及序列分析

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:smn1970
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防御素(defensins)是广泛分布于动物和植物界的一类富含半胱氨酸的阳离子抗菌肽,是生物体内先天性免疫的重要组成成分。根据防御素的分子结构特征和来源不同可分为α-防御素、β-防御素、θ-防御素、昆虫防御素和植物防御素五种类型。其中β-防御素在人、哺乳动物和禽类体内的上皮组织中被发现有广泛表达。 本研究首先通过反刍动物β-防御素的cDNA的保守序列设计引物,从驯鹿舌黏膜上皮组织中提取总RNA,采用RT-PCR(RevetseTrariscriptionPCR)技术扩增出reBD-1(reirideerβ-defensin-1)cDNA的中间片段,接着我们采用RACE(RapidAmplificationofcDNAEnds)法,成功的扩增了驯鹿β-防御素reBD-1的cDNA全序列。 reBD-1cDNA全序列长372bp,其中包含192bp的开放读码框(OpeningReadingFrame,ORF),44bp的5’非翻译区(5’UTR),118bp的3’非翻译区(3’UTR)以及poly(A)15。该ORF编码64个氨基酸残基的reBD-1前原肽,其中包含20个氨基酸残基的信号肽、6个氨基酸残基的前片段和38个氨基酸残基的成熟肽。在预测的38个氨基酸残基的成熟肽中有10个带正电荷的氨基酸残基(6个精氨酸R,3个赖氨酸K,1个组氨酸H),没有带负电荷的氨基酸残基,因此reBD-1成熟肽是阳离子肽。 核酸序列及氨基酸序列的同源性分析表明:reBD-1与牛的β-防御素同源性最高,与山羊、绵羊和骆驼的β-防御素之间的同源性次之,与人和猪的β-防御素的同源性最低。由此可以看出reBD-1无论是核酸序列还是氨基酸序列,在进化关系上与其它反刍动物的β-防御素近,与人和猪的较远。
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