创新已成为推动区域经济社会发展的不竭动力,它决定着一个地区的竞争能力与发展潜力。2010年1月,国务院正式批复《皖江城市带承接产业转移示范区规划》,安徽省皖江城市带承接产业转移示范区建设正式纳入国家战略,为安徽乃至中部崛起点燃了助推器。三年来,皖江城市带承接产业转移示范区紧紧围绕总体目标进行建设,创新科技成果不断涌现,区域创新能力得到不断提升,皖江示范区八市经济发展迅速,同时也带动了安徽省经济的发展,不断成为安徽经济发展新的“增长极”。评价分析皖江示范区的创新绩效,能有效推进示范区创新体系建设,提升示范区的综合实力,对加速安徽崛起具有重要意义。　　首先,本文对区域创新系统的国内外研究现状进行总结,主要对区域创新系统的运行机制、建设方面的研究进行分析,对区域创新绩效的评价体系、评价方法及DEA方法的改进方面进行总结,并阐述了相关理论,为本文的研究提供了理论基础。　　其次,本文对皖江示范区八市的经济及科技发展现状进行了分析,根据指标设计的原则、相关研究及皖江示范区科技统计现状,建立了皖江示范区八市的创新绩效评价指标体系。为了科学、有效、系统地评价示范区的创新绩效,本文选取了皖江示范区八市以及安徽省其它地市进行参照比较,将因子分析与超效率DEA模型相结合,对传统DEA方法中的不足进行改进,先从投入、产出指标体系中提取投入、产出公因子,根据提取出的公因子,运用DEA改进模型—超效率DEA方法对样本的创新绩效进行评价,得出效率值及排名。结果发现:皖江示范区中有五个城市为DEA有效,区域创新绩效总体效果较好,马鞍山、滁州和宣城三市处于非DEA有效状态,需要进一步提高创新资源的利用效率。皖北各市中除了宿州为DEA有效外,其他各市均为非DEA有效,皖北地区的创新绩效水平较差。皖中和皖南的其他城市也都处于非DEA有效状态。　　最后,根据上述的评价结果,本文对皖江示范区以及安徽省其他地市的创新绩效进行分析,找出创新障碍,并提出了提高创新绩效水平的政策建议。