14例结直肠癌患者肠道粘膜微生态多样性研究

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目的观察结直肠癌患者肿瘤组织和癌旁组织之间肠道微生态构成及多样性。方法选取14名接受手术治疗的结直肠肿瘤患者,取肿瘤组织(粘膜面14份,浆膜面14份)、14份相对应粘膜癌旁组织(距肿瘤4~7cm),应用QIAamp DNA Mini Kit从肿瘤组织(浆膜、粘膜)及癌旁组织内提取细菌DNA,PCR法扩增细菌16s DNA V3-V5区序列,行琼脂凝胶电泳检测目的基因。然后采用454测序方法,对结直肠肿瘤组织及癌旁组织进行测序,观察两者肠道细菌的组成。结果1.肠道粘膜面肿瘤组织与癌旁组织可见细菌基因扩增,而浆膜面肿瘤组织未见细菌基因扩增。2.454测序结果:Shanonn指数在两组样品中差异有统计学意义(p<0.05),肿瘤组织与癌旁组织OTU数目分别为4156±471和4612±931,Chaol指数分别为846±231和906±286,两者比较差异无统计学意义(p>0.05);在门水平,两组样本菌落组成是相似的;在属水平,大部分菌属是没有差异性的,肿瘤组织中,苍白杆菌属、梭菌属、芽孢杆菌属内所占比例分别为0.0465±0.011,0.0712±0.012,0.308±0.076,高于癌旁组织中所占比例0.0367±0.006,0.0605±0.009,0.230±0.065,差异有统计学意义(t=2.806,p=0.015;t=2.775,p=0.016;t=2.536, p=0.024);肿瘤组织中考拉杆菌属、甲基杆菌属及脱硫杆菌属所占比例为分别为0.078±0.007,0.0168±0.009,0.0985±0.041,低于癌旁组织中所占比例0.917±0.022,0.0262±0.007,0.134±0.039,差异有统计学意义(t=2.178,p=0.048;t=3.517,p=0.004;t=2.314,p=0.038).结论:1.对于结直肠肿瘤T分期为T4a或T4b的患者,浆膜面肿瘤组织未见细菌存在。2.结直肠肿瘤患者粘膜面肿瘤组织与癌旁组织肠道细菌的群落组成整体相似,但存在差异有统计学意义的细菌。
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