现代药物的研发主要是针对疾病中某一特定的病理过程而设计的单靶点药物。然而,人体是一个十分复杂的网络系统,疾病的发生和发展牵涉到网络中的多个环节。单一分子靶点的药物虽然能治愈多基因相关疾病如癌症、或影响多个组织或细胞类型的疾病如糖尿病等,但其存在的问题逐渐被人们所认识。随着系统生物学的出现和不断发展,多靶点药物为药物发现提供了一种全新的思路。多靶点药物的优势在于其对各靶点的作用能够产生协同效应,使其总效应大于各单效应之和。多靶点药物治疗能够同时调节疾病网络中的多个环节,克服许多单靶点药物的局限性,不易产生耐药性,发挥较好的治疗效果。由于在炎症和癌症过程中体现出的重要作用及两者密切的关系,诱导型一氧化氮合酶(iNOS)和环氧合酶-2(COX-2)已经成为很多药物研究者关注的热点。虽然其各自的单靶点抑制剂已有较多研究,但多数抑制剂因为副作用问题被搁浅,越来越多的研究者开始了对COX-2和iNOS双靶点抑制剂的专门研究。本文尝试运用基于配体的药物设计和基于受体的药物设计方法,来筛选iNOS和COX-2双靶点抑制剂。基于配体的药物设计利用现有的iNOS和COX-2单靶点抑制剂来构建各自的3D-QSAR模型,结合分子对接,对商用化合物库进行虚拟筛选,然后利用化学合成和生物活性检测,得到两个先导化合物2029和2030。基于受体的药物设计方法是利用分子对接的方法,对中药复方仙鹤延龄方所包含的化合物分子库进行虚拟筛选,得到两个评分较好的化合物,分别为儿茶素和4’,7-二羟基黄酮,而且这两个化合物具有类似的骨架结构,这为设计新型iNOS和COX-2双靶点抑制剂提供了一定的参考。