背景:流行性乙型脑炎（简称乙脑）是由乙型脑炎病毒（JEV）感染所致的一种人兽共患病。乙脑是亚太地区病毒性脑炎的主要病因,它的病死率高且容易出现神经系统后遗症,对人类健康危害巨大。JEV分为5个基因型,目前使用的乙脑疫苗对基因5型JEV保护效果欠佳。近十余年来基因5型JEV在亚洲多次出现并已在韩国引起人类乙脑,中国沿海地区（包括广东省、浙江省和山东省）与韩国均处于东亚乙脑传播循环圈,也存在一定的基因5型JEV传播的风险。采用分子生物学方法难以确定患者所感染的JEV基因型,但由于诱导机体产生中和抗体相关的E蛋白在不同基因型中存在差异,所以可通过比较同一患者中不同基因型JEV的中和抗体水平,来确定患者所感染的JEV基因型。目前,尚无关于中国是否存在基因5型JEV感染人类的报道。本研究在沿海三个省份的乙脑患者中开展回顾性血清流行病学调查,了解哪个基因型的JEV与人类关系更密切,同时确定中国是否存在基因5型JEV感染的患者。方法:采用横断面研究设计和便利抽样方法。收集2018-2019年广东省、浙江省和山东省的部分乙脑患者血清和个案调查信息,将血清标本进行JEV Ig M抗体检测、JEV核酸检测和基因1、3、5型JEV交叉中和试验。比较同一份血清标本的基因1、3、5型JEV中和抗体滴度,若某个基因型的中和抗体滴度相对其他两种中和抗体滴度有4倍及以上升高,则判为该基因型的JEV感染。结果:共纳入三个省份49例乙脑患者,其中广东省、浙江省和山东省各11、20和18例。所有标本JEV Ig M抗体均为阳性,所有标本JEV核酸检测均为阴性。基因1、3、5型JEV的中和抗体滴度几何均数分别为1:19.17、1:51.00和1:8.56,基因1、3、5型JEV的中和抗体阳性率分别为77.55%、93.88%和38.78%。通过交叉中和试验,确定基因1、3、5型JEV感染患者分别1例、15例和1例,另外32例患者未能根据交叉中和试验推断出其所感染JEV的基因型。结论:2018-2019年广东省、浙江省和山东省乙脑患者性别以男性居多;低年龄组0-14岁和高年龄组>40岁可能是乙脑的高发人群;7、8月份是这三个省份的乙脑发病高峰季节。2019年浙江省可能存在基因5型JEV感染的乙脑患者。2018-2019年广东省、浙江省和山东省乙脑患者中基因1、3和5型JEV共同循环,可能以基因3型JEV感染居多。