经济全球化进程中，保障国家经济安全已然成为我国不容忽视的问题，如何建立和完善维护国家经济安全的制度框架成为防范国家经济风险的重要举措。政府审计作为国家治理的重要组成部分，如何满足公民的需要，利用其专业素质和公信力对国家经济安全进行评价，对突发性重大经济损失进行预防，对重大经济项目参与进行监督，确保国家经济健康稳定发展成为政府审计应该思考的重要问题。本文基于公共受托经济责任论和国家治理论对政府审计维护国家经济安全的动因进行了理论分析；基于审计免疫系统论对政府审计维护国家经济安全的免疫功能进行重新定位，认为政府审计应从以公民需求为导向、引入市场机制和问责机制出发，充分发挥其维护国家经济安全的免疫预防、稳定和监视功能。最后本文基于审计免疫功能构建了维护国家经济安全的政府审计模型。该模型包括两大要素：目标要素和路径要素。其中目标要素是维护国家经济安全，而路径要素即安装“防火墙”、“稳定器”和“监视器”三个基本“软件”，以夯实政府审计的国家治理属性和实现政府审计维护国家经济安全的目标。而维护国家经济安全的政府审计模型必须强调人、技术和策略（包括法律、法规、制度、管理）三大条件才能得以实施。