作为海洋原生生物群落的重要组成部分,微型鞭毛虫和浮游纤毛虫在海洋微食物网物质循环与能量流动中发挥了重要作用。本研究在2015年12月至2016年8月期间,对东海长江冲淡水区域冬、春、夏三个季节微型鞭毛虫丰度及生物量分布、浮游纤毛虫群落结构组成和粒径/口径分布,及其对环境因子的响应进行了探究。主要研究结果如下:1)2015冬季共鉴定浮游纤毛虫49种,其中寡毛类37种,丁丁虫8种,其他类群4种。优势种5种。粒径在20-40 μm和口径在10-20 μm的纤毛虫为纤毛虫群落的优势类群。粒径2-5μm微型鞭毛虫是微型鞭毛虫群落的优势类群。微型鞭毛虫和浮游纤毛虫的丰度和生物量与深度、盐度、温度及营养盐等环境因子不显著相关。2)2016春季共鉴定浮游纤毛虫75种,其中寡毛类52种,丁丁虫14种,其他9种。共计5个优势种。粒径在20-40 μm和口径在5-10 μm的纤毛虫为优势类群。粒径2-5μm微型鞭毛虫是微型鞭毛虫群落的优势类群。微型鞭毛虫和浮游纤毛虫的丰度和生物量与深度和盐度显著相关,与温度则不显著。3)2016夏季共鉴定浮游纤毛虫71种,其中寡毛类51种,丁丁虫15种,其他5种。共计7个优势种,粒径在10-20 μm和口径在5-10 μm的纤毛虫为优势类群。粒径2-5μm微型鞭毛虫是微型鞭毛虫群落的优势类群。微型鞭毛虫和浮游纤毛虫的丰度和生物量与深度、盐度、温度、溶解氧以及营养盐显著相关。4)微型鞭毛虫和浮游纤毛虫的丰度、生物量以及纤毛虫群落结构都体现出明显的季节性分布,冬季的各项数值明显小于春、夏两季。在三个季节中均为优势种的纤毛虫是双瓣急游虫(Strombidium bilobum)。三个季节的LogHNF-Log Bac的模型中显示异养微型鞭毛虫(HNF)的丰度均受到纤毛虫的下行控制。不同季节东海水团组成各异,微型鞭毛虫与纤毛虫群落在水团间分布差异显著,水团是影响其分布的重要因素