枯草芽孢杆菌丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PrkA对芽孢形成的影响

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枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)在营养匮乏或者处于极端环境时,能够诱导产生内生孢子(芽孢)。作为一种典型的模式微生物,其芽孢形成过程由于相对简单,而成为研究原核生物、真核生物细胞分化、细胞不对称分裂过程的典型。目前人们对枯草芽孢杆菌芽孢形成的大致过程已有比较深入、系统的研究。但是该过程是一个十分复杂的多基因调控过程,所以仍有部分基因的调控机制尚未研究清楚,包括σE调节子中prkA基因。prkA基因编码的蛋白,属于腺甘酸活化的蛋白激酶(AMPK,AMP-acti-vated protein kinase)超家族,被推测是一种重要的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,受细胞内AMP/ATP水平的调控,从而影响信号传导通路中下游其他蛋白的磷酸化水平。  在真核生物系统中,PrkA,又称AMPK或STPK,主要是在细胞代谢中发挥重要作用,参与包括细胞增殖、细胞凋亡、细胞自噬、内质网应激等多种生物学功能。因此,真核系统中PrkA/AMPK/STPK因与哺乳动物的重要代谢过程及重大疾病的产生密切相关,而成为近年来国内外研究的热点。在原核模式生物枯草芽孢杆菌中,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PrkA由芽孢特异性sigma因子σE转录,所以推测其功能可能与芽孢形成有关。但其在芽孢形成过程中具体的功能及其作用机制的研究,迄今为止国内外均无报道。针对以上问题,本研究以枯草芽孢杆菌模式菌株B.subtilis168为出发菌株,系统探讨了丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PrkA在芽孢形成过程中的作用及其相关分子机制。  本论文的主要研究结果如下:  1.确定丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PrkA为芽孢形成相关蛋白。通过在诱导芽孢形成过程中添加PrkA抑制剂araA,发现当PrkA蛋白功能被抑制时,其芽孢形成水平明显降低。随后通过同源重组双交换的方法敲除了B.subtilis168 prkA基因,对敲除菌株△prkA进行了芽孢形成表型的鉴定。结果发现△prkA敲除菌株芽孢形成水平与野生型相比显著下降,说明了PrkA的缺失确实会降低枯草芽孢杆菌芽孢的形成水平,所以确定PrkA为芽孢形成相关蛋白。  2.揭示PrkA蛋白参与芽孢形成的具体阶段。通过报告基因和realtime-PCR检测芽孢形成过程中,B.subtilis168野生型与△prkA敲除菌株中不同阶段重要sigma因子及下游报告基因的表达情况。结果显示,在△prkA敲除菌株中,σK及下游基因gerE的表达量与野生型相比均明显下降,说明PrkA可能是通过直接或间接地影响σK的表达,从而参与σK的合成及其下游靶基因调控过程。在此基础上,通过在△prkA敲除菌株中过表达sigK基因实验,证实因PrkA的缺失引起σK表达量下降所导致的出孢显著降低的表型,可以通过回复表达sigK使突变株的出孢能力恢复至野生型水平的60%。  3.解析PrkA蛋白参与芽孢形成相关分子机制。利用生物信息学方法分析σK编码基因sigK的启动子区,确定其中潜在的转录调控元件,通过报告基因检测B.subtilis168野生型与△prkA敲除菌株中sigK的启动子区不同转录元件的表达情况,结果发现:PrkA蛋白通过负调控Hpr(ScoC)来直接或间接地影响sigK的表达,从而调节芽孢的形成。  本论文的创新性主要体现在以下几个方面:  本研究首次证实了B.subtilis168丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PrkA在芽孢形成中的作用。  首次揭示了PrkA蛋白通过负调控Hpr(ScoC)来直接或间接地调控sigK的表达,从而调节芽孢形成的分子机制。
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