草鱼cyclinG1和Morg1基因的克隆、鉴定及适应性进化分析

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本研究从已构建的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肝肾cDNA文库中克隆到草鱼细胞周期蛋白G1和Morg1。细胞周期蛋白G1(cyclin G1, CCNG1)为非典型性细胞周期素,功能具有复杂性,不仅参与DNA复制还在促进凋亡和信号转导中起作用。草鱼细胞周期蛋白G1(cyclin G1, CCNG1)全长cDNA为2118 bp。其中5’端非翻译区255 bp,3’端非翻译区963 bp,开放阅读框为256-1155 bp,编码299 aa。草鱼细胞周期蛋白G1的N端57-143 aa有一高度保守区称细胞周期蛋白盒能识别相应的周期蛋白依赖的蛋白激酶,C端189-261 aa的EGF_Lam区域可能存在磷酸化位点调节信号转导。草鱼细胞周期蛋白G1与斑马鱼的同源性为90%,此外与其他鱼类(大西洋鲑Salmo salar、虹鳉鱼Poecilia reticulata)同源性在70%以上,与两栖类、哺乳类的同源性为40-63%。系统进化树也显示草鱼细胞周期蛋白G1与斑马鱼的亲缘关系最近。MAPK组织蛋白1(Morg1)是一种分子支架蛋白,通过与MP1(MEK partner-1)相互作用可影响或调节细胞的生长发育、细胞周期、信号转导等过程。草鱼MAPK组织蛋白1(Morg1)全长cDNA为1402 bp。其中5’端非翻译区204 bp,3’端非翻译区241 bp,开放阅读框为205-1161 bp,编码318 aa。草鱼MAPK组织蛋白1含有7个WD40重复序列,N端22-67 aa为Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂区域可调控蛋白酶活性,C端228-269 aa有泛素脱羧水解酶类锌指区域能协助完成泛素周期。草鱼MAPK组织蛋白1与其他鱼类(斑马鱼Danio rerio、大西洋鲑Salmo salar)同源性在90%以上,与两栖类、哺乳类的同源性均在70%以上。系统进化树也显示草鱼MAPK组织蛋白1与斑马鱼的亲缘关系最近。密码子替换模型是检测基因序列单个密码子位点选择作用的统计学方法,能够有效地检测基因在进化历程中是否受到选择作用,并且可以预测出那些在进化过程中对功能分化有重要贡献的、受正选择作用的密码子位点。用该模型来分析cyclin G1和Morgl的分子适应性,适应性进化分析的结果表明cyclin G1编码蛋白的26A、171A、225K氨基酸位点受到正选择作用。未发现Morg1正选择位点。
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