目的调查长江武汉段地表水微生物污染现状；研究地表水中菌落总数、总大肠菌群、耐热大肠菌群、大肠埃希菌、肠球菌五种细菌学指标之间的关系，分析其与致病菌沙门菌的相互关系，及其与温度、pH之间的相关性，寻求最具有代表性的地表水粪便污染指示菌。方法与2011年9月-2012年5月对长江武汉段地表水及同济医院医院污水进行连续采样，采集长江岸边及江心两固定点水样和同济医院排污管水样，以医院污水作为对沙门氏菌检测的阳性对照组。对水中的菌落总数、总大肠菌群、耐热大肠菌群、大肠埃希菌、肠球菌及沙门氏菌进行定量或定性分析，并分析其相关性。结果参照《中华人民共和国地表水环境质量标准》GB3838-2002分析，60份长江水水样中，耐热大肠菌群的超标率为55.0%，检出有沙门氏菌的水样有12份，检出率为20.0%。结果分析显示，总大肠菌群、耐热大肠菌群、大肠埃希菌密度与沙门氏菌的检出率均呈正相关，耐热大肠菌群对肠道致病菌的提示作用最好。结论长江武汉段地表水微生物污染严重，五种候选指示菌对致病菌污染水体均有一定的提示作用，但耐热大肠菌群对肠道致病菌的提示作用最好，建议使用耐热大肠菌群联合肠球菌作为肠道致病菌污染地表水的指示菌。