单片段代换系(single segment substitute line,SSSL)是一种重要的次级作图群体,是进行复杂基因分析,特别是QTL定位的理想材料。本研究以玉米骨干自交系综3为供体亲本,许178为受体亲本,通过杂交、回交和SSR(Simple Sequence Repeats)分子标记跟踪供体的染色体片段的方法,构建了以许178为遗传背景的综3染色体单片段代换系(Single segment substitution lines,SSSLs)群体,并在此基础上,利用包含74个不重复代换片段,覆盖玉米基因组的47.85%的105份SSSL纯合体对玉米株型及开花期相关性状进行了2个实验环境的QTL分析,主要研究结果如下:1.以综3为供体亲本、许178为受体亲本,经过4个世代回交和3个世代自交,结合SSR分子标记辅助选择,共获得了239份纯合的单片段代换系材料。其中包括158个不重复代换片段。158个代换片段不均匀的分布在玉米的10条染色体上,片段长度为0.95-186.03cM,平均长度为47.67 cM,总长度为11394.22cM,覆盖玉米基因组4481.74 cM,基因组覆盖率为67.56%2.利用105份SSSL通过浚县、许昌2试验点共鉴定了196个玉米株型及开花期相关性状QTL,其中株高32个,穗位高20个,穗位高/株高21,总叶片数26个,穗上叶片数17个,穗上叶片数/叶片数12个,叶面积21个,散粉期14个,吐丝期16个,ASI(散粉-吐丝天数)17个。196个QTL中有49个QTL在2个试验环境中重复检出,重复检出率为25.00%。在2个试验环境中重复检出、效应较大且一致的玉米株型和开花期性状QTL主要有:控制株高的qPH-1-2,qPH-1-3,qPH-2-4,qPH-5-2,qPH-9-2;控制玉米穗位高的qEH-2-3,qEH-2-4,qEH-3-2,qEH-5-2,qEH-9-1;控制玉米穗位高/株高的qEH/PH-2-4,qEH/PH-2-5,qEH/PH-3-1,qEH/PH-3-4;控制玉米总叶片数的qLN-1-4,qLN-2-4;控制玉米穗上叶片数的qLANE-1-1,qLANE-2-1;控制玉米穗上叶片数/总叶片数的qLANE/LN-2-3,qLANE/LN-2-4,qLANE/LN-5-1;控制玉米叶面积的qLA-2-3,qLA-4-1;控制玉米散粉期的qDPOLL-2-2;控制玉米吐丝期的qDSILK-2-1,qDSILK-2-3;控制玉米ASI(散粉-吐丝天数)qDASI-2-3,qDASI-4-1,qDASI-4-3和qDASI-6-1。3.在检测到的株型和生育期QTL中,存在成簇分布的现象。在染色体bin2.04-bin2.06、bin5.05、bin9.04多次重复检测到控制玉米株高、玉米穗位高、玉米穗位高/株高、玉米穗上叶片数、玉米穗上叶片数/总叶片数、玉米叶面积,开花期性状QTL,表明控制这些性状的QTL存在成簇分布现象,推测上述染色体区段是控制玉米株型及开花期相关性状QTL的热点区域。这些位于染色体相同区域的相同标记区间内,同时控制玉米不同株型和开花期相关性状的QTL,对其加以利用可以起到多效的目的,大大提高分子标记辅助选择的效率,在育种实践中具有重要意义。