随着创新型国家战略的不断推进,国家不断加大财政对科技的投入,科技在国民经济中的地位也越来越重要。在这种大背景下,对政府财政科技投入的绩效评价也就成了必然的要求,具有十分重要的理论价值和实践价值。本文首先简述了研究背景、研究意义和国内外的研究综述,得出政府对于财政科技的投入是有必要的,而当前对于各个省市地方的财政投入绩效研究较少。再结合公共选择理论、新制度经济学理论和公共选择理论的研究,构建了本文分析财政科技投入的理论框架,建立了研究方向。在对江苏省财政科技投入的现状分析中,得出江苏省财政科技绩效水平有待提升,江苏省科技对于经济贡献度较低。在实证研究中,根据财政科技投入绩效研究的特点,选取相关指标,构建数据包络模型(DEA)对江苏省2000-2014年的财政科技投入进行绩效分析。结果显示江苏省的DEA有效年份占60%,综合效率尚可,同时还显示R&D人员投入存在冗余、产出效率低下、财政科技投入增速放缓等方面的问题。最后本文根据江苏省财政科技投入的现状与实证分析的结果,以基础理论为依据,从宏观制度层面、财政科技投入和产出三个角度分别提出了提高江苏省财政科技投入绩效的建议,包括完善财政投入绩效评价制度和相关配套法律法规建设,建立多元化的科技投入来源和重视人才的培养管理,大力支持产学研结合与支持科研机构和高校的研究。