多个子群体中位点间连锁情形的异质性检验

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连锁分析是遗传制图及基因定位的重要方法之一,其通过对基因数据的分析,在基因组内去寻找被关注的基因的位置.基因定位本质上是对于基因组内的给定的遗传标记,利用统计方法确定关注的位点与遗传标记间的距离,这个距离可以通过重组率借助图谱函数转换得出.连锁情形的正确分析对基因定位起着非常重要的作用.   在连锁问题中,通常是默认所考察的群体在相同的位点间共享一个重组率,而有些真实的遗传数据资料突显出,不同群体在相同位点闯的连锁可能存在异质性,即不同群体在相同位点间的重组率是不同的,连锁异质性的存在会降低连锁分析结果的可靠性,进而影响基因定位的准确性.与此同时,连锁异质性的存在也为标记位点附近的基因研究提供了新的思考,为许多复杂疾病的致病原因提供了更为合理的解释,因此,检验疾病的致病位点与标记位点间的连锁是否具有异质性,对生物学、遗传学以及医学研究等方面的工作有非常重要的价值与意义.   本文探讨了两位点间连锁异质性的检验问题.在遗传连锁分析中,基于似然比思想和LOD计分检验的连锁异质性检验方法有K检验、A检验、B检验和D检验.其中,常用的方法为K检验和A检验,本文提出一种不同于上述4种检验的新方法,称之为G检验,在回交模型下给出了检验统计量构造的一般理论和形式,并推广到杂交模型.我们将G检验与常用的K检验和A检验进行了一些模拟比较,在模拟得出的检验统计量样本分位点数值、第一类错误率以及功效这些方面,G检验要优于K检验和A检验,并且在实例计算中G检验的检验结果也是很理想的.
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