水稻OsDHHC基因的生物信息学分析及OsDHHC13基因的功能研究

来源 :湖南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhongyuzhang09
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
随着研究的深入,越来越多的DHHC型锌指蛋白的功能被报道,它们在真核生物整个生命活动过程中发挥重要作用。过去对DHHC蛋白的研究主要集中在哺乳动物、酵母以及拟南芥中,而对水稻中OsDHHC蛋白的研究甚少,大部分基因功能尚未报道。因此,我们利用生物信息学与实验结合的方法对水稻中OsDHHC型锌指蛋白进行了分析并且重点对OsDHHC13基因的功能进行研究。获得了如下主要研究结果:(1)通过对水稻中30个OsDHHC基因的生物信息学分析,发现OsDHHC基因结构具有高度保守性,30个OsDHHC基因的蛋白序列具有6个完全一样的保守氨基酸残基并且他们DHHC-CRD结构域富含Cys残基。进化树分析发现,30个OsDHHC基因家族可分为a, b, x, s, t,c和d七个亚家族,同一亚族基因中内含子与外显子数目基本相同且结构相似且同一个亚家族除了含有共同的DHHC结构域以外还具有高度相似的其他结构域。通过基因图谱发现有26个OsDHHC基因在水稻的根、茎、叶、花序以及胚芽中都有不同程度的表达,表明这些基因能在水稻不同时期不同组织发挥其功能。(2)通过对水稻幼苗非生物胁迫(盐、冷冻、脱水)处理并且对水稻OsDHHC基因表达模式进行分析。结果发现:有12个OsDHHC基因在不同程度上上调或下调,而其中尤以c亚族对非生物胁迫最为敏感,暗示这12个基因可能参与非生物胁迫响应的调控。(3)利用生物信息学对OsDHHC13基因分析发现,OsDHHC13蛋白是具有四段跨膜结构域的膜蛋白并且通过其空间结构的分析发现该蛋白具有硫酰基转移酶活性中心,说明该蛋白具有棕榈酰化的功能。对启动子分析发现该基因启动子序列含有多种光调控、逆境胁迫以及激素响应元件,说明该蛋白有可能参与植物的光信号转导、激素转导以及非生物胁迫响应。(4)成功构建重组质粒35S::OsDHHC13并通过农杆菌浸染水稻愈伤组织诱导获得8个过表达株系。利用DNA水平以及RNA水平鉴定筛选出3个株系并通过组织表达模式分析发现,该基因在幼苗期水稻主要在茎和叶中表达但是根有一定表达量,而在生殖生长期该基因主要在叶、根和叶鞘中表达。(5)分别用NaCl、PEG4000、H2O2和低温对野生型Kitaake水稻处理,并对OsDHHC13基因表达量进行分析检测发现,OsDHHC13能够被Nacl、PEG以及H202诱导,说明该基因可能与盐胁迫、干旱胁迫以及氧化胁迫相关。(6)在正常情况下,转基因株系与野生型水稻幼苗根长几乎没有差异。当使用一定浓度H202对水稻幼苗处理后发现,过表达株系的根长显著长于野生型。对其根部H2O2进行测定发现,过表达株系根部H2O2含量显著低于野生型。定量分析发现过表达株系根部与ROS合成或清除相关基因OsSOD1、 OsCATB、OsAPX1和OsAPX2的表达量显著提高。这些结果表明,在氧化胁迫条件下OsDHHC13确实能促进清除ROS的相关酶基因表达,从而调节内源性H2O2含量的动态平衡,最终解除H2O2对根的生长与发育的抑制。以上结果初步证明:在水稻进化史上OsDHHC基因及蛋白结构具有高度保守性。他们参与水稻各个时期生理功能的调控。在氧化胁迫条件下OsDHHC13表达量增加并通过促进清除ROS的相关酶基因表达,从而调节内源性H2O2含量的动态平衡,最终解除H2O2对根的生长与发育的抑制,说明OsDHHC13基因参与水稻体内氧化胁迫反应。
其他文献
品牌形象挖掘是了解品牌形象的关键步骤,是塑造提升品牌形象、制定品牌传播策略的第一步,对品牌形象构建以及品牌竞争都具有深远的意义。随着互联网技术的高速发展,用户随时
区域宗教史是宗教史研究的基础,是一个地区整体宗教史研究的有机组成部分。宗教的变迁能够折射该地区政治、经济、文化、教育以及意识形态的演化。因而对土默特地区宗教史的研
学位
乳糖酶存在于小肠黏膜吸收细胞的刷状缘内,主要作用是使乳糖水解为葡萄糖和半乳糖,在乳糖的消化、吸收中起作用。乳糖酶缺乏是指小肠黏膜刷状缘乳糖酶数量不够或活性低下,如乳糖
针对哈齐(哈尔滨-齐齐哈尔)客运专线CRH5型动车组车体异常抖动的情况,调查了异常抖动的车辆状态和抖车区段的线路情况,计算分析了轮轨匹配等效锥度和轮轨接触几何关系。结果
APP客户端已成为移动图书馆最重要的服务模式之一。仅依靠引进通用的移动图书馆产品难以满足读者需求,构建智慧图书馆APP成为移动图书馆服务的新方向。文章调研国内外主流移
中国农村扶贫涉及的组织机构膨大,管理层级多,职能条块分割,加大了农村扶贫工作的协调难度与运行成本;现行农村扶贫治理机制中,农村扶贫资金与项目决策职能与执行职能合一、
<正>2016年9月出台的《中国学生发展核心素养》,一经发布就引发了社会的广泛关注,"核心素养"也相应成为教育界的热词,相关学术研究和文章应运而生,一个崭新的话题就这样诞生
在"互联网+"迅猛发展的背景下,网络政治参与正在蓬勃发展,政府回应正在发生着变革:新的回应渠道诞生、回应意识增强、回应速度变快、回应质量提升,政府回应力在不断增强。政府回
在探讨了出行者对交通信息需求特点的基础上,对交通信息分为动态、静态和关联三类。为了充分掌握动态交通信息,设计了基于第3代移动通信技术(3G)的城市交通信息系统3层平台方
目的:探讨错配修复缺陷对贝伐珠单抗治疗转移性结直肠癌的预后影响。方法:回顾性分析2012年2月至2015年2月在中山大学附属第六医院应用贝伐珠单抗联合化疗和单纯化疗治疗转移