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内生真菌在植物中普遍存在,很多内生真菌具有促进植物生长发育、增强宿主植物对病虫害的抗性以及对非生物胁迫的抗性等作用。对于内生真菌的研究目前多采用分离培养方法。本文主要对所在实验室保存的瓜类植物内生真菌资源进行了系统分类研究。为较全面了解黄瓜内生真菌的多样性,还采用非培养方法对于黄瓜不同组织中内生真菌的群落结构开展了研究。取得了如下主要结果:1、对所在实验室收集的1591株瓜类植物内生真菌,通过ITS序列与GenBank中序列比对和基于ITS序列的分子系统学研究,这些菌株主要涉及子囊菌门Dothideomycetes 中的 Capnodiales、Pleosporales 和 Botryosphaeriales,Sordariomycetes中的 Glomerellales、Hypocreales 和 Sordariales,Eurotiomycetes 中的 Eurotiales;共鉴定出真菌84属,232种,包括疑似新种8个。2、通过形态学研究和基于多基因序列系统分析了 Phialemoniopsis、Plectosphaerella 和 Talaromyces 三个属的菌株,描述 了新种 4 个即 Ph.endophytica、Pl.sinensis、T.cucurbitiradicus和T.endophyticus;发现供试瓜类植物内生真菌中Plectosphaerella 属有 2 个种 Pl.cucumerina 和 Pl.sinensis,Talaromyces 属有 6 个种 T.cnidii、T.pinophilus、T.radicus、T.wortmannii、T.cucurbitiradicus 和 T.endophyticus。此外,本研究明确了Plectosphaerella属各个种的分类地位以及系统发育关系,并将ITS和TUB序列多态性引入到Talaromyces属相近种的鉴定。将84株模式或参照真菌菌株保藏至中国农业微生物菌种保藏管理中心(ACCC),向GenBank提交了 201条DNA序列。3、通过高通量测序研究了露地栽培黄瓜的根、茎、叶中内生真菌的多样性,分析测序结果共有919个真菌的操作分类单元(Operational taxonomic unit,OTU),主要由子囊菌门(69.21%)和担子菌门(24.81%)真菌组成。座囊菌纲格孢腔菌目真菌广泛分布于黄瓜各组织中,以叶部分布最多,其中Alternaria在黄瓜所有组织中都作为优势属存在;而根部主要以粪壳菌纲小丛壳目和粪壳菌目真菌以及子囊菌门酵母为主。黄瓜内生真菌在根、茎、叶中的Chao1指数均值分别是448.77、285.01和270.85,Shannon多样性指数均值分别是5.23、3.20和2.70。本文结果进一步明确了瓜类植物内生真菌的物种组成和主要类群,发现了新的真菌物种,初步揭示了黄瓜不同部位内生真菌的群落结构和多样性,为进一步了解瓜类植物内生真菌的生态学功能奠定了基础。