长链非编码RNA在脑胶质瘤中的功能研究

来源 :南京医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huandakedi222
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
长链非编码RNA在多种疾病特别在恶性肿瘤中异常表达并在其肿瘤发生发展过程中起关键性作用,但在人类脑胶质瘤中鲜有文献报道。本研究致力于研究lncRNA在脑胶质瘤中可能产生的作用。项目组利用lncRNA表达谱芯片技术对三例胶质瘤组织进行检测,检测结果发现在肿瘤组织中,相对于瘤周组织平均4858条lncRNA发生显著改变,其中2845条lncRNA被检测出在肿瘤中上调(倍数改变>3.0),2013条lncRNA发生明显下调(倍数改变e<1/3)。同时,平均4084条mRNA表达发生改变,2280条表达量上升(倍数改变>3.0),1804表达量下降(倍数改变e<1/3)。随后,通过差异表达显著程度和lncRNA在组织中的基础表达量为标准选择了六条lncRNA (ak125809,ak098473, uc002ehu.1, bc043564, NR027322, uc003qmb.2)利用实时定量PCR在40例胶质瘤病人的肿瘤和瘤周组织中进行了验证,6条1ncRNA在肿瘤中有明显的表达差异,并与芯片结果一致。我们利用差异表达的lncRNA和mRNA建立了共表达网络,其中显示很多mRNA,如LOC729991、NUDCD1、SHC3、PDGFA、MDM2等以及lncRNA如 ENST00000425922、ENST00000455568、uc002ukz.1、ENST00000502715和 NR027873在胶质瘤形成中起到关键作用。在通路分析中,我们发现’’GLIOMA"信号通路具有很高的富集度,并且其中的关键基因如SHC3、PDGFA、MDM2等与lncRNA表达改变关系密切,并有作为相应lncRNA下游靶基因的潜力。本研究在全基因组范围内运用lncRNA芯片技术在胶质瘤中进行检测,并在大量病例样本中进行验证,通过建立lncRNA-mRNA共表达网络,以及通路分析等分析,进一步预测了lncRNA的靶基因。研究结果表明,有一系列lncRNA在胶质瘤组织中有显著的表达差异,如ak125809, ak098473, uc002ehu.1等在肿瘤中表达上调,bc043564, NR027322, uc003qmb.2等则在肿瘤中表达量有明显减少,而这种差异提示了lncRNA在肿瘤发生发展中起到关键的作用。’’GLIOMA"signal pathway可能是lncRNA参与调控胶质瘤发生发展的通路之一。近年大量的研究结果证实长链非编码RNA (lncRNAs)在肿瘤的发生发展过程中发挥了重要的调控作用。报道称LncRNA SPRY4-IT1 (GenBank ID:AK024556)在黑色素瘤中高表达,并且与黑色素瘤细胞的迁移能力相关。本研究拟通过检测SPRY4-IT1在脑胶质瘤中的表达,研究SPRY4-IT1对脑胶质瘤细胞功能的影响,初步揭示SPRY4-IT1在脑胶质瘤中的作用及相关分子机制。收集40例脑胶质瘤手术标本(癌组织和癌旁组织),荧光实时定量PCR(qRT-PCR)检测40例标本中S PRY4-IT1的表达,并分析其与临床病理资料的关系;qRT-PCR分别检测脑胶质瘤细胞U87, U251和瘤周组织中SPRY4-IT1的表达。构建质粒和慢病毒,建立过表达SPRY4-IT1的稳转细胞株,用CCK-8、流式细胞技术、细胞划痕实验和Transwell实验检测细胞的增殖、凋亡和迁移能力。显微镜下观察SPRY4-IT1低表达和过表达前后细胞形态的变化;SPRY4-IT1在脑胶质瘤组织中的表达量(1.6±0.4)高于癌旁组织(0.9±0.7),差异有统计学意义(P<0.05), SPRY4-IT1在U87,U251细胞中表达明显升高(P<0.05)。成功构建SPRY4-IT1过表达稳转细胞株,划痕实验和Transwell实验证实SPRY4-IT1可促进脑胶质瘤细胞迁移。但CCK-8、流式细胞技术结果显示SPRY4-IT1对细胞增殖和凋亡无明显影响。相较瘤周细胞,SPRY4-IT1在脑胶质瘤细胞中高表达,并促进脑胶质瘤细胞的迁移,对细胞增殖和凋亡无明显影响。
其他文献
饲料企业经过多年的发展,在营销渠道中分销商的选择方面还存在一定的问题。笔者在现有研究成果的基础上,对饲料企业营销渠道的分销商选择指标进行了更深入的研究,围绕分销商
为探讨无创痛艾灸缓解和抗运动性疲劳的作用,以大学生运动员为研究对象,采用实验法探讨无创痛艾灸对大学生运动员运动后的心率、皮肤两点辨别阈,闪光融合率、血乳酸、血氨等
研究了不同植物生长调节剂对黄瓜及辣椒种子发芽的影响。结果表明:植物生长调节剂对黄瓜种子发芽的影响比对辣椒种子发芽明显;与其它植物生长调节剂相比,AAB对黄瓜及辣椒种子
<正> 数百年来的唐宋词研究,大抵围绕“豪放”“婉约”来做文章,业已形成的传统格局对唐宋词研究的限制显而易见。已故词学大师唐圭璋先生的高足王兆鹏博士怀着能在这一研究
抗生素,可以帮助人类有效地杀灭很多对威胁人类及动物生命安全的细菌、病毒、真菌等。然而,不科学地使用抗生素,非但不会帮助人类解决难题,有时甚至适得起反,引发神经毒性、
人类文明的进步需要竞技体育的可持续发展,竞技体育的可持续发展需要正确合理的战略谋略的支持。全运战略与奥运战略作为我国竞技体育战略的重要组成部分,在促进我国竞技体育
本文主要对国内先进中厚板剪切机—滚切式斜刀片剪切机的设备结构和技术性能进行介绍,本剪切机的显著特点是:弧形上刀刃是在平直的下刀刃上滚动剪切的,上刀刃相对钢板的滑动
文章从高级财务会计课程的特点出发,阐述了翻转课堂在高级财务会计课程教学中应用的意义,并构建了基于翻转课堂的高级财务会计教学模型。
环氧沥青混合料是一种新型的高强钢桥面铺装材料。主要通过低温弯曲试验与低温弯曲蠕变试验来评价环氧沥青混合料的低温性能,再结合线收缩系数试验分析了环氧沥青混合料在钢
为了提高广西瑶鸡的生产性能,本试验以中国地方鸡种广西瑶鸡Y系为终端父本,与两系配套组合AH、DH、MH进行三系杂交配套试验,杂交后代分别为YAH、YDH、YMH。通过对杂交后代外