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猪瘟、蓝耳和圆环2型病毒感染是当前世界养猪业中危害最大的三种疫病,且这三种病毒在我国养猪业中普遍存在感染现象,且三种病原的传播途径和媒介多种多样,继发感染或者混合感染现象也普遍存在。屠宰猪作为猪肉供应的第一个环节,其健康状况和带毒情况需要更为严格的检验,以防止病原通过市场流通的猪肉而向周围传播。本研究对广西某市屠宰场采集的640份淋巴结,通过三种主要疫病病原的检测,分析健康屠宰猪中的带毒情况。结果表明,在健康猪中存在三种病原感染的情况,CSFV、PRRSV和PCV2的阳性率分别为5.12%,10.24%和43.88%,其中PCV2的带毒情况最严重。在25份3种病原混合感染分析中,有24份与PCV2感染有关,仅有1份为PRRSV与CSFV混合感染。本研究通过对检测为阳性的淋巴结样品,对其进行ORF2基因克隆与序列分析,得到20株ORF2序列,其中有4个为702bp,15个为705bp,有1个为704bp,序列分析发现特殊的704bp ORF2序列存在1个碱基的缺失。同源性研究表明本实验所得的20株ORF2与PCV2a标准株AF055391的同源性为90.5%-93.4%；与PCV2b的标准株AF055393的同源性为94.2%-99.3%；与PCV2c的标准株EU148503的同源性为89.5%-91.0%。对于国内的PCV2毒株,与广东PCV2毒株AY035820的ORF2同源性最高,为94.8%-99.0%,与北京PCV2毒株AY381176的ORF2同源性最低,为90.0%-93.0%。通过遗传进化树分析可知,从屠宰猪获得的20株圆环病毒2型ORF2基因分属于PCV2a、PCV2b和PCV2d三个亚型,没有PCV2c型毒株。其中218、529、543、202和213属于PCV2b,与广东株AY916791、浙江株AY217743和法国经典株AF055393处于同—分支；501、530和532属于PCV2a,与广东株AY035820的亲缘性最近,与PCV2a经典株AF055391处于同一分支；510、544、541、540、536、507、528、534、548、535、522和538属于PCV2d,与湖南株AY943819的亲缘性最近。