本文针对我国科技投资项目评价中存在的现实问题,在综合掌握国内外关于科技投资项目评价理论与方法研究现状的基础上,通过借鉴系统理论、新福利经济学、多属性效用理论和实物期权理论等相关理论,以企业为评价主体,从科技投资项目的效益和阶段两个方面的评价展开深入研究,并力求秉承理论来源于实践又应用于实践的研究主旨。在对科技投资项目进行效益评价时,本文先从经济效益、社会效益、环境效益、技术效益和运行环境分析五个子系统的评价入手,针对其特点和主要目的,运用适当的评价方法进行评价,而后运用综合评价方法即层次灰色评价方法,构建了较为完整的评价指标体系,对科技投资项目系统进行评价,在此过程中评价指标的设计、评价方法的选取和评价模型的构建构成了其核心内容。在对科技投资项目进行阶段评价时,本文以阶段门模型为基础,运用二叉树实物期权理论对其进行评价,并将以上理论运用于某企业项目评价的实际,经验证取得了较好的效果。本文力求从科技投资项目效益和项目阶段两个角度为企业的科技投资项目评价提供助益。