本研究对可以在宁夏正常成熟的286份外引水稻种质资源的表型性状进行遗传多样性分析,并结合SSR分子标记,研究这些外引水稻种质资源的基因型遗传多样性,探讨了不同地理来源的水稻种质之间的亲缘关系,通过表型和SSR分子标记分析,构建核心种质,结果如下：1、对外引水稻种质资源的表型性状调查发现,宁夏外引水稻种质资源在10个质量性状上表现较为一致,在17个数量性状上差异都达到极显著的水平。表型遗传多样性分析表明,数量性状的平均Shannon遗传多样指数为2.13,而质量性状的Shannon遗传多样性指数仅为0.23。2、利用表型性状对宁夏外引水稻种质资源进行聚类分析,结果表明：以欧氏距离0.84为阈值,可将宁夏外引水稻种质资源划分为四类,第Ⅰ类包含8份材料,总粒数较多,为大穗型材料;第ⅡⅡ类共66份材料,实粒数多,结实率高,为高产型材料：第Ⅲ类仅包含3份材料,为日本引进材料,属于矮秆小穗类型；第Ⅳ类包含209份材料,占到总数的73.08%,为中间类型材料。按照地理来源划分后的聚类结果显示,在欧氏距离为0.8966时,可将不同地理来源的水稻分为四类,其中第Ⅰ类仅包括葡萄牙水稻品种；第Ⅱ类包括黑龙江和吉林的水稻资源;澳大利亚的水稻资源单独聚在第Ⅳ类；其余在第Ⅲ类。3、对外引水稻种质资源的SSR标记结果显示,外引水稻种质资源每个位点的平均等位基因数为3.5357,有效等位基因数的变异幅度为1.0428-4.7667。平均Shannon遗传多样性指数为0.6145,其中RM1306, RM3513和RM3509等标记表现为较高的等位基因数和较高的基因多样性。12条染色体中chr9的基因多样性指数最高。4、对不同地理来源的水稻种质资源进行SSR多样性分析表明,Shannon多样性指数(Ⅰ)变幅在0.0619-0.6161之间,其中意大利的多样性指数最高,达到0.6161,台湾的最低,为0.0619,北京和云南的多样性指数也较高,分别为0.6002和0.5977。此外,意大利,北京,云南的水稻种质资源等位基因数,多态性位点相对较高。可见,不同地理来源的水稻资源间其多样性有一定的差异。SSR遗传距离和聚类结果显示,东北三省和日本的水稻种质资源亲缘关系较近,遗传距离较小,均在0.0300左右,葡萄牙与台湾种质资源的遗传距离最远,为0.4571。葡萄牙与其它地方的水稻品种遗传距离均相对较远。5、通过对286份外引水稻种质资源的表型性状和SSR分子标记进行分析,以原种质的10%作为核心种质,共28份材料,表型方差变异为8235%,符合均值差异百分率小于20%,同时满足极差符合率大于80%。核心种质材料间的平均遗传距离为0.4611,变异幅度为0.1814-0.8065,材料的系谱来源复杂,性状类型多样,遗传距离较远。核心种质虽然保留了原资源材料的10%,多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数和Shannon信息指数的保留率分别为94.64%,94.64%,88.99%,101.11%,106.02%,由此可见,构建出的核心种质不仅能很好地代表原有种质的遗传变异,而且又减少了种质资源的数量,为水稻育种提供了理论基础。