通过定向进化和半理性设计提高顺式环氧琥珀酸水解酶的热稳定性的研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nightcatwu
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顺式环氧琥珀酸水解酶(cis-epoxysuccinate hydrolase)是一种环氧化物水解酶(sEHs, EC 3.3.2.10)。其功能是不借助辅因子或金属离子催化环氧琥珀酸的环氧键的水解,形成特定手性的酒石酸。本文研究的顺式环氧琥珀酸水解酶催化产生L(+)-酒石酸。此类cis-epoxysuccinate hydrolase (CESH)存在于多种微生物体内,如根瘤菌(Rhizobium)、假单胞菌(Pseudomonas)、诺卡式菌(Nocardia)、棒状杆菌(Corynebacterium)和红球菌(Rhodococcus)。CESH在工业上得到了应用,其优点在于催化效率高,立体选择性好。但目前工业生产所用的CESH自身的稳定性差,催化剂的使用寿命较短,提高CESH的稳定性可以进一步提高工业生产的效率。本研究选取目前工业生产所使用的来自红球菌(Rhodococcus)顷式环氧琥珀酸水解酶,经过密码子优化后合成该基因(GenBank DQ471957),构建重组质粒pET8a(+)-CESH;转入宿主菌E. coli BL21(DE3),构建工程菌E. coli BL21(DE3)/pET-28a(+)-CESH;使用IPTG诱导表达,分析其活性及热稳定性。野生型CESH的比活力为76.5 U/mg,其50℃下的半衰期(t1/2,50℃)为8.5 mmin,其T5015(酶在该温度下15 mmin内丧失50%活力)为44.0℃。设计了针对该酶热稳定性的高通量筛选方法,优化了易错PCR的反应条件。经定向进化改造,得到一株突变体1X-1(Q122R),比活力为75.8 U/mg,t1/2,50℃为31.6 min,T5015为49.5℃。在此基础上,以突变体1X-1为母本进行进一步的定向进化改造,均未能得到更好的突变体有益突变,改造受阻。因此,研究转向选择半理性设计思路对CESH进行进一步的改造。以突变体1X-1为母本,利用“多重序列对比”手段预测可能对蛋白质热稳定性有利的氨基酸替换方式,得到两株热稳定性较高的突变子,2X-2(Q122R,F26V)釉2X-4(Q122R, I83R)。突变体2X-2的比活力为76.1 U/mg,t1/2,50℃为162.1 min, T5015为54.6℃。突变体2X-4的比活力为74.3 U/mg, t1/2,50℃为44.0 min,T5015为50.4℃。利用定点突变将突变体2X-2和2X-4的突变位点结合在一起,得到突变体3X (Q122R,F26V, I83R),其比活力为75.5 U/mg,t1/2,50℃为170.8 min, T5015为55.4℃。以突变体3X为母本,利用“计算机模拟突变”预测能提高其热稳定性的氨基酸替换方式,得到了具有更高热稳定性的两株突变体,4X-4 (Q122R, F26V, I83R, D8K)和4X-6 (Q122R, F26V, I83R, S90R)。突变体4X-1的比活力为75.8 U/mg,t1/2,50℃为225.2 min,死015为61.6℃。突变体4X-6的比活力为75.2 U/mg, t1/2,50℃为180.5 min, T5015为56.5℃。将突变体4X-1和4X-6的突变位点结合在一起,得到了突变体5X (Q122R, F26V, I83R,D8K, S90R),其比活力为74.3 U/mg, t1/2,50℃为237.1 min, T5015为62.4℃。以突变体5X为母本,在其8位点,26位点,83位点,90位点和122位点上分别进行定点饱和突变,筛选出一株带有更高热稳定性的突变体5X-1 (Q122R, F26W, I83R, D8K, S90R),其比活力为75.1 U/mg, t1/2, 50℃为293.2 min,T5015为64.8℃。相较于野生型CESH,突变体5X-1的催化效率没有明显下降,并且具有极高的热稳定性和酸碱耐受性。突变体5X-1在50℃下酶活力的半衰期提高了33.5倍,T5015则提高了20℃;最适pH值范围则由野生型的8.0-9.0扩展到了5.0-10.0,大大提高了酶的pH值耐受性。另外,将突变体5X-1固定化后所得的生物催化剂的活力较固定化野生酶提高了一倍;并且固定化野生型CESH在37℃,45℃和50℃下的半衰期分别是13天,5天和2天,而固定化突变子5X-1的半衰期在50℃和45℃下分别为25天和35天,在37℃下反应38天后仍残余65%的活力,使用寿命得到了极大的延长。
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