随着我国政治和经济体制改革的深入和国民经济的发展，各级政府公共开支的大幅度增长，经济资源与需求矛盾的日益尖锐。政府运作的节约、效率、效果如何，为大众所关注。在这样的环境中，绩效审计逐渐登上了政府审计的历史舞台。县级审计机关绩效审计作为审计监督系统的重要组成部分，已成为一种趋势，受到广泛重视。本文回顾了县级审计机关绩效审计的历史和现状、分析了现阶段县级审计机关绩效审计的特点，指出县级审计机关绩效审计存在的问题，主要体现在：审计独立性不强、缺少明确的政府绩效审计操作依据、缺少绩效评价指标体系、优秀审计人才储备不足等问题。基于上述，本文力求从新的角度，提出推进县级审计机关绩效审计的体制创新的一些想法。主要包括：改革现行审计管理体制；改进绩效审计的具体实施程序，实现绩效审计流程再造；探索创新绩效审计的方法；构建绩效审计的评价标准体系；实行绩效审计全过程的质量控制。最后，结合审计实际工作，介绍县级审计机关开展的绩效审计实例。希望本文的探讨能起到抛砖引玉的作用，为我国县级审计机关绩效审计的理论与实务探索尽自己的微薄之力。