当前农业自然灾害频频发生、资源环境矛盾不断加深、市场风险不断加大,不确定因素逐渐增多,农业发展正面临着一系列严峻挑战,必须要加快发展现代农业来突破物质装备、科学技术、观念落后等瓶颈制约,以增强农业抗风险能力与农产品供给能力。然而,发展现代农业需要的资金规模更大、周期更长、形式更加多样化,如何在现有条件下建立起稳定的投入增长机制和强大的支持保护力度,以保障农业资金的有效供给是现代农业建设中面临的主要问题。本文在资金配置理论、公共财政理论、不完全市场竞争理论的指导下,首先利用描述性统计分析法解析了四川省现代农业发展的基本情况以及资金供给情况,再构建了DEA模型和Tobit模型探究资金支持的效率及其影响因素。研究结果表明：各投资主体对农业资金投入的重视程度不够,支持能力匮乏,支持力度不足；各主体投入资金的绩效水平并不高,纯技术效率过低是造成其低效性的主导因素；全省大部分地区都处于规模报酬递减阶段,农业投入的产出弹性比较小；资金支持的绩效水平同经济发展水平和城镇化程度背道而驰；增加农业人口数与提高农机使用量都能显著提高资金支持绩效。由此可见,在资金的投入过程中存在重视程度不高,力度不足,能力匮乏等问题,而在运用过程中表现出资金管理体系混乱,资金配置功能失衡,资金运用环境不加等诸多问题。针对以上问题,本文提出了以下几点对策措施：第一,加强社会责任意识培养,改革干部政绩考评体系,以强化投入主体的重视程度；深化农村产权改革,扩大对外开放程度,以增强资金的供给能力。第二,稳定财政投入增长幅度,增加农村金融服务供给,吸引社会资金参与“三农”,以稳定农业投入增长率,强化支持保护力度。第三,缩减中间拨付环节,完善奖补制后期监管机制,以改善资金的管理体系；改善资金投入领域和运用主体的结构比例,以优化资金配置结构,提高资金技术效率；第四,改善资金运行环境,提高资金支持的绩效水平。