库尔勒香梨苹果茎沟病毒分子检测及部分基因组序列克隆与分析

来源 :石河子大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:catshadow6
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苹果茎沟病毒是危害果树最为严重的侵隐病毒之一。近年来发现库尔勒香梨受苹果茎沟病毒等多种病毒的危害,造成了树体生长不良,果实品质和产量下降,带来了严重的经济损失。本试验对危害梨树上的苹果茎沟病毒进行分子检测,建立了快速、准确的检测体系,同时对部分序列测序以及序列分析,以便进一步了解这种病毒基因结构和功能,为今后的香梨抗病育种及实现香梨苗木的无毒化生产提供理论基础。本实验在提取到高质量的RNA基础之上进行特异片段的扩增,扩增片段进行了株系间同源性比较,结果表明与来源于百合的L和Li-23(AB004063、D16681)和来自柑橘的两个分离物(D14455 D16368)的亲缘关系较远,与Kuerle’s pear、P-209、AF233298的亲缘关系较近;利用斑点杂交和多重RT-PCR对ASGV进行检测,得到了该病毒的检测限点为5-7。本实验的主要结论如下:1.本实验以香梨不同组织为材料,在实验室常规的RNA提取方法上进行了筛选和改进,得到了针对不同香梨组织的总RNA提取方法。2.以提取的总RNA为模板,利用特异性引物进行RT-PCR反应,获得长度为524bp的特异性片段。测序结果经blast比对,特异片段的同源性可达到92.75%。并将特异片段与ASGV其他分离物进行核苷酸和氨基酸同源性分析,得到了它们之间的亲缘关系。3.利用克隆质粒,用Biotin-11-dUTP和DIG-11-dUTP标记cDNA探针,对ASGV病株进行检测,用Biotin-11-dUTP标记探针检测限点可达5-2;用DIG-11-dUTP标记cDNA探针检测限点可达5-3。4.建立对ASGV和ACLSV同时检测的一步RT-PCR体系,并对不同带病样品进行检测确定了该体系的稳定性和特异性;该体系的检测限点可达5-7,其灵敏度是斑点杂交的54倍。
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