miR-486-5p对非小细胞肺癌细胞蛋白表达调控的蛋白质组学分析

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目的:我们前期工作发现 miR-486-5p 是肺癌中最显著低表达的miRNAs之一,其在痰液和外周血中表达有助于肺癌的早期诊断,通过调控靶基因ARHGAP5、Pim-1表达参与肺癌的生长、侵袭与转移等过程。鉴于miRNA对基因表达调控的复杂性,本研究拟在前期工作的基础上,进一步通过iTRAQ(IsobaricTag forRelative andAbsoluteQuantitation)蛋白质定量技术对miR-486-5p 调控的靶基因进行筛选和评价,以期更加全面地揭示其在肺癌中的作用机制。  方法:  体外培养H1299和H157细胞,给予miR-486质粒或空载体转染筛选获得稳定细胞株;采用Taqman microRNA assay方法验证miR-486-5p的表达;提取细胞总蛋白采用iTRAQ定量蛋白质组学技术检测细胞中蛋白质表达情况,并对两组细胞中差异蛋白进行分析。应用SPSS Statistics17.0软件,计量资料以均数±标准差((x)±?s )表示,数据采用t检验,P<0.05认为差异有统计学意义。  结果:  1. 利用iTRAQ技术检测过表达miR-486-5p对H1299细胞蛋白表达谱的变化:  与对照组相比,H1299-miR-486-5p细胞中25个蛋白表达上调,27个蛋白表达显著下调。表达上调的蛋白主要与氨酰基-tRNA生物合成通路相关;表达下调蛋白主要与核糖体通路相关。差异蛋白间的相互关系主要包括:SLIT1(下调)-POTEJ(上调)-PDP2(上调);AP4S1(上调)-RAB6B (下调)-TB22B(上调);DD19B(上调)-XPO6(下调)。  2. 利用iTRAQ技术检测过表达miR-486-5p对H157细胞蛋白表达谱的变化:  与对照组相比,H157-miR-486-5p 细胞中表达上调的蛋白有 70 个,而表达下调的蛋白有135个。表达上调蛋白参与的相关信号通路包括核糖体生物合成、剪接体、RNA 转运等。而表达下调蛋白与内质网蛋白质加工通路显著相关。差异蛋白间的相互作用包括:SLIT1(下调)- EPHA2 (下调)-RHOA(下调)-DOCK1(上调);TYY1(下调)-BIRC5(上调)-CTCF(下调)-GRB10(上调)等等。  3. 两种过表达miR-486-5p细胞中共同调控蛋白的筛选  对两种细胞的差异蛋白结果取交集后发现,仅 SLIT1 基因在两组细胞中表达均下调。  结论:  1. 筛选获得了稳定过表达miR-486-5p的H1299和H157细胞。  2. H1299-miR-486-5p 细胞中 25 个表达上调的蛋白主要与氨酰基-tRNA生物合成通路相关;27个表达下调蛋白主要与核糖体通路相关。  3. H157-miR-486-5p 细胞中 70 个表达上调蛋白参与的相关信号通路包括核糖体生物合成、剪接体和RNA转运等。135个表达下调蛋白主要参与内质网蛋白质加工等相关通路。  4. SLIT1 基因在两种过表达 miR-486-5p 的细胞中均表达下调,提示SLIT1基因可能是miR-486-5p所调控的靶基因之一。
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