本文通过探究不同种类海水养殖贝类对微生物富集能力以及影响贝类微生物富集能力的因素，同时对港湾型滩涂贝类养殖方式划型布点原则及结果进行分析，并对浙江省乐清湾、嵊泗自然海域养殖贝类微生物卫生现状的调查分析。具体研究内容包括:(1)开展同一贝类养殖生产区域内不同贝类种类富集微生物能力的比较。(2)开展生长环境中影响贝类微生物富集的主要因素研究和富集规律调查。(3)调查在极端恶劣环境下（暴雨、暴晒等），养殖区域内贝类中微生物含量的增减规律。(4)抛物线布点法应用于贝类产品微生物和环境微生物监测。(5)乐清湾和嵊泗养殖贝类卫生现状监测与评价。　　实验结果表明:(1)缢蛏富集大肠杆菌的能力比泥蚶和文蛤强，文蛤和泥蚶富集大肠杆菌的能力无显著性差异，而三个种类富集菌落总数的能力无显著性差异。(2)贝类生长环境中水质的变化在一定程度上影响了贝类富集大肠杆菌，而底泥中微生物的变化对贝类富集大肠杆菌影响并不直接。(3)持续降雨后遇到晴天，泥蚶和缢蛏富集微生物的能力加强，贝肉内大肠杆菌和菌落总数数值偏高。(4)缢蛏样品中大肠杆菌和菌落总数的数量沿乐清湾北部沿岸均呈类似抛物线的分布，其数值在乐清湾顶部采集的缢蛏样品中显示最高，并且沿贝类河床往下呈减少趋势。且大肠杆菌与菌落总数的数值呈一定的正相关。(5)缢蛏大肠杆菌与海水粪大肠菌群的含量也呈一定的正相关。(6)对比同一纬度线上三个点，粪大肠菌群数值呈现中间低两边高的趋势，即位于中间监测点采集的海水比沿岸监测点采集的海水粪大肠菌群数值相对较低。(7)以乐清湾和嵊泗为代表的浙江省沿海贝类养殖区卫生情况总体上有明显提高。嵊泗县贝类样品大肠杆菌指标达一类卫生标准比例比乐清湾高，说明嵊泗县贝类养殖区环境优于乐清湾。