由于高新技术企业的高智力资本等特点,仅仅用财务指标评价高新技术企业的绩效存在很多缺陷。平衡计分卡作为发展较为成熟的工具,恰好适应了高新技术企业的特点,能够全面、科学、客观地评价高新技术企业的绩效。本文首先通过对高新技术企业绩效评价研究现状的分析,指出存在的问题。然后阐明平衡计分卡的基本原理,结合其在企业中的应用情况,对平衡计分卡在实践中存在的问题进行分析,接着对平衡计分卡用于高新技术企业绩效评价进行可行性分析。然后对高新技术企业绩效评价的关键问题进行分析,包括其绩效的影响因素分析、R&D绩效评价、智力资本评价等问题,指出高新技术企业绩效评价应该注意的问题。在此基础上,从平衡计分卡的财务、客户、内部流程和学习与成长四个方面构建了高新技术企业绩效评价体系。最后,利用层次分析法、变异系数赋权法和灰色关联系数分析法对高新技术企业的绩效评价进行实例分析,评估出企业的绩效结果,进一步提出应用平衡计分卡评价高新技术企业绩效的建议。