《伤寒论》以卓越的诊断和治疗效果著称,其核心架构“六经体系”必然揭示了某些重要的生命科学内涵。耗散结构理论则提供了以物理学原理认识生命现象的途径,在此之前,物质在生命现象中表现出的某些特性,仍然无法以物质的物理性质加以解释。生命现象是物质运动的结果,耗散结构理论对于生命现象的理解和《伤寒论》对于医学的认识,应当可以在生命现象的物理性质中找到共同点。耗散结构理论能够在实验室中详细分析的均属简单的耗散结构系统,直接应用在人体耗散结构的分析时,会遇到因复杂度差异而造成的困难。但在以耗散结构理论分析《伤寒论》的过程中,可以发现《伤寒论》提示了能以简单耗散结构系统中的三个物理特性来分析复杂的生命体耗散结构,即耗散结构“主体”、物质能量流“环境”和温度。在生命现象中,除了耗散结构“主体”之外,维持物质能量流“环境”是生命现象存在的另一要件,是生命现象耗散结构系统消耗能量和产生热能的主要生理过程。温度一方面是特定的生命状态(健康或疾病)的表征,一方面也是影响生命状态的因素。人体耗散结构系统的最终温度,取决于生理过程中产生的热能的速率,和人体控制热能向外界流失的速率。《伤寒论》六经体系以“寒热”状态和“水谷之气”出入机体的情况作为临床诊断和治疗的依据。两者在中医学的理论基础分别是“阳气”和“气机”的概念。“阳气”是人体气机正常运行的动力,部分相当于耗散结构系统维持物质能量流的功能和能量来源,“气机”是人体产生“阳气”的机制和过程,部分相当于耗散结构系统经物质能量流补充能量和维持“主体”结构的机制和过程。具体而言,三阳病阳气充足,以发热为主要症状。太阳病恶寒发热,涉及“水”在体表和膀胱的输出,即排汗和排尿的过程;阳明病发热不恶寒,涉及“糟粕”的排出;少阳病寒热往来,涉及“水谷”在出入之间的转化,以热象和阳气的状况判断,主要与老化的“主体”结构转化为终代谢物的过程有关。三阴病阳气不足,以恶寒为主要表现。太阴病恶寒为主,可见发热,涉及“谷”经运化输入机体的过程;少阴病恶寒为主,可见发热,涉及“水”的输入过程;厥阴病厥热互见,相对于少阳病,主要涉及将营养物质(水谷之气)转化为组织结构的相关过程。《伤寒论》六经体系以“寒热”状态和“水谷”出入机体的情况作为临床诊断和治疗的依据的医学观,提示了如何抽离简单耗散结构的物理特性,分析复杂的人体耗散结构系统;反之,以耗散结构理论理解《伤寒论》六经体系,使《伤寒论》六经体系以“寒热”状态和“水谷”出入机体的诊断和治疗方法,得到了具体的科学支持,在医学领域,使《伤寒论》六经体系更容易被理解和操作。