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炭疽菌属是很多植物重要的病原菌、内生菌和腐生菌,能引起像炭疽病、花后落果、泪痕、水果的蒂腐病,嫩枝的叶尖凋萎等,在作物收获前和收获后都能致病。紫茎泽兰是危害最为严重的外来入侵植物之一,调查紫茎泽兰内生的高度富集的炭疽菌物种多样性,能为探索和揭示紫茎泽兰入侵机制,并将为炭疽菌病害的控制提供理论依据。我们调查了来自云南省14个样地,即沧源,峨山,耿马,昆明,弥渡,南华,南涧,宁洱,思茅,西盟,元江,云龙,云县和竹塘的紫茎泽兰内生的炭疽菌的物种多样性,总共分离菌株263株,基于这些菌株的甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)基因的编码序列,选择了17个代表菌株用于多基因系统发育分析,基于8个位点(ACT,CAL,CHS-1,GAPDH,GS,HIS3,ITS,TUB2)联合的系统发育分析和菌株的表型特征,并对其中的176株胶孢炭疽菌复合种进行Ap Mat,GS片段联合分析。在263个菌株中共鉴定出23个种,新种5个,分别是C.nanhuaensis,C.ningerensis,C.yuanjiangensis,C.yunlongensis,C.yunxianensis。已知种18个,分别是:C.boninense,C.brevisporum,C.cangyuanensis,C.citricola,C.cliviae,C.fioriniae,C.fructicola,C.gigasporum,C.gloeosporioides,C.henanense,C.jasmini-sambac,C.jiangxiense,C.kahawae subsp.ciggaro,C.kahawae subsp.kahawae,C.karstii,C.nymphaeae,C.siamense,C.spicatum。其中,C.nanhuaensis,C.yuanjiangensis,C.yunlongensis,C.yunxianensis,C.cangyuanensis,C.fructicola,C.gloeosporioides,C.henanense,C.jasmini-sambac,C.jiangxiense,C.kahawae subsp.ciggaro,C.kahawae subsp.kahawae,C.siamense属于C.gloeosporioides复合种。C.boninense,C.citricola,C.karstii,C.spicatum属于C.boninense复合种。C.fioriniae,C.nymphaeae属于C.acutatum复合种。C.gigasporum属于C.gigasporum复合种。C.brevisporum和C.cliviae不属于任何复合种。加上前期本课题组鉴定的5个新种,紫茎泽兰内生的炭疽菌中共计有28个种,说明了紫茎泽兰内生炭疽菌的物种多样性。除新种外,23个种都是从紫茎泽兰中首次报道。在14个样点中,除弥渡外,其余13个样地都分离到了C.gloeosporioides复合种,共计176株,说明这个复合种在地理分布上十分广泛,为了进一步分清复合种内的种,我们结合脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶2-交配基因间隔区(Ap Mat)和谷氨酰胺合成酶编码基因(GS)对该复合种内的菌株进行系统分析,所有的种都能被分清。相比其他基因位点,我们发现结合Ap Mat和GS位点的系统发育分析更为有效,因为它在大多数物种水平的进化支上都提供了更好的分辨率,因此我们推荐将Ap Mat和GS位点结合起来用于有效鉴定胶孢炭疽菌复合种内的物种。内生炭疽菌的分离频率随入侵时间的延长增高,在紫茎泽兰入侵80年的地区比入侵50年的地区更容易分离到炭疽菌。