线粒体D-Loop区序列变异与福建省汉族聚集地女性早期乳腺癌预后的相关性研究

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:chenbin198718
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:研究表明多基因、多阶段的协同作用促进了乳腺癌的发生与发展,个体遗传因素对乳腺癌预后的作用不可忽视。过去10年来,线粒体DNA被发现与乳腺的发展和预后有关。D-Loop区是线粒体DNA的调控中心,它包含复制转录的起始区域和启动子。该区域的变异可能调节线粒体基因的转录与表达,从而引起编码基因产物的表达失调,进而影响多种疾病的结局,包括癌症、线粒体疾病等。因此,本研究对福建省汉族聚居地女性早期乳腺癌患者的外周血白细胞线粒体D-Loop区全部序列进行测序,结合相应的临床病理学资料和预后相关指标,探索分析线粒体DNA D-Loop区序列变异与早期乳腺癌预后的相关性,寻找可能作为早期乳腺癌预后的特异性、无创性指标。方法:本研究采用Sanger测序法,对2003至2013年就诊福建医科大学附属协和医院的714例福建省汉族聚居地女性早期乳腺癌患者的外周血白细胞线粒DNA D-Loop区全序列进行测序。并以无浸润性疾病生存(i DFS)、无远处疾病生存(DDFS)、乳腺癌特异性生存(BCSS)和总生存(OS)为观察终点。利用Logistic回归对各临床病理学因素与早期乳腺癌预后的相关性进行评估,筛选对预后有影响的临床病理学因素;以单因素COX风险模型对D-Loop区存在变异的344个位点进行分析,筛选对预后有影响的变异位点;以有意义的临床病理学因素作为校正因子,利用COX多因素回归模型对有意义的变异位点与乳腺癌的预后进行再次分析;对筛选出的位点进行分层分析,寻找携带变异位点的对预后有影响的特定亚组人群;绘制Kaplan-Meier生存曲线,评估变异位点对乳腺癌四种预后指标的影响;利用ROC曲线、曲线下面积评估临床病理学因素和变异位点对乳腺癌预后的评估作用。结果:本研究中,D-Loop区全序列中共有344个位点存在不同程度、不同类型的变异。变异类型主要有替换(315,91.6%)、插入(12,3.5%)、缺失(9,2.6%)和替换/缺失(8,2.3%),其中在替换中A→G、T→C变异类型最多见。COX多因素分析发现位点146和16266变异可能与福建省汉族女性早期乳腺癌患者的预后有关。其中位点146携带碱基A或C可减少无浸润性疾病生存时间[ad HR=1.39(1.05-1.85),p=0.023]。整合分析结果显示,两位点对乳腺癌四种预后指标的影响存在明显的统计学意义[i DFS:ad HR:1.407(1.122-1.766),p=0.0032;DDFS:ad HR:1.366(1.083-1.723),p=0.0085;BCSS:ad HR:1.475(1.149-1.895),p=0.0023;OS:ad HR:1.380(1.074-1.774),p=0.0117]。此外,ROC曲线结果显示,纳入了临床病理学因素和两位点变异信息(位点146或位点16266)的模型对早期乳腺癌预后的预测效果要比单独纳入临床病理学因素的模型要好[BCSS,AUC=0.7407 VS 0.7569,p=0.0344;for OS AUC=0.7359 vs0.7473,p=0.0340]。结论:本研究表明,当患者位点146、16266发生变异时,可以影响早期乳腺癌的复发、转移和死亡,特别是对肿瘤>2cm、淋巴结阳性、ER阳性或组织学3级的患者。位点146和16266变异可能可以作为早期乳腺癌特异性生存或总生存的预测指标,但目前尚不能证明其可以做为复发或转移的预测因素。
其他文献
关系抽取是自然语言处理的关键基础任务之一,其目的是从自然语言文本中识别出两个实体间所存在的语义关系。目前关系抽取方法主要分为有监督、无监督和远程监督三种,其中,远程监督基于“包含相同实体对的句子都在表述实体对在知识库中的对应关系”的假设,解决了人工标注语料费时费力的问题,成为关系抽取的重要研究方向之一。虽然远程监督可以快速获取大规模语料,但是却不可避免的产生错误标注问题。多示例学习的引入和深度学习
随着知识成为21世纪市场竞争最有利的资源,大型建设工程项目团队对于知识学习越来越重视,大型建设工程项目本身具有历时长、环境复杂、组织团队临时性、人员来源跨组织,专业
随着科技的进步和人类认知的不断加深,复杂网络也越来越引起研究者的兴趣.本文中,我们研究了几类网络分别为一类加权无标度网络,顶点—顶点图,一类迭代的加权自相似剖分网络
从能源及可持续发展角度,催化选择性氧化过程具有重要的工业应用前景。通过环己烷选择性氧化制备的环己醇和环己酮的混合物(KA油)是重要的化工中间体和石油化工原料。然而,工业
现在计算机能够对图像进行更快更深层次地分析与处理,这意味着数字图像可以提供更多的信息。人们可以通过机器自动理解和分析图像或视频内容来改善人们的日常生活。但与此同时,人们也希望自己的隐私不受到侵犯,因此如何在二者之间取得平衡,这对于许多实际应用来说是亟待解决的问题。针对此问题,通过对图像中的视觉隐私信息进行合理的分析与处理,能够在一定程度上消除图像视觉隐私威胁并保持图像满足要求的可视性和机器可理解性
信贷是解决我国牧区贫困问题的重要政策手段,尤其是自我国提出“精准扶贫”的战略目标后,信贷作为帮助牧民创造多样化生计来源的主要金融手段而被推动,因此,牧民的信贷行为及
我国南方亚热带旱地红壤由于亚热带季风气候以及人为因素退化严重,土壤肥力低,生物多样性降低和逐渐酸化。针对这一现象,向旱地红壤中有机畜禽粪便(有机肥)能有效地解决这些问题,但有机肥的施用会增加土壤CH_4、N_2O排放,向有机肥(动物粪便)堆肥中添加生物炭以及把这种生物炭-有机肥堆肥混合物施入到土壤中,可提高作物产量和减少CH_4和N_2O排放,具有重要的实用价值以及应用前景。鉴于材料对生物质炭的影
随着全球经济的高速发展,化石能源的消耗造成了能源的枯竭以及严重的生态污染,而氢能具有绿色清洁、储量丰富以及可循环利用的特点,深受世界各国的重视。其中,金属氢化物储氢
随着对河道、湖泊及海洋更深入的开发利用,水面设备的数量和船舶使用量也随之增加,加上现在环保意识不强,进而伴随着水面垃圾增多而导致污染、水面设备和船舶过多而导致航行事故等情况频繁发生。船舶识别、常见垃圾和海洋设备的识别可以为垃圾清理和船舶交通监测等应用提供研究基础。因此如何识别出垃圾、水面设备和行驶船只,对环境和水面交通的治理有着很重要的意义,因此有非常大的研究价值。基于深度学习的相关机器视觉技术在
焊接结构是很多大型工件的关键部位,对工业生产和日常生活产生较大影响,所以对焊接结构进行质量检测是必不可少的环节。在层出不穷的检测方法中,超声导波检测法因其具有一次