具有干细胞特性的循环肿瘤内皮细胞对胰腺癌预后的影响及其单细胞全外显子组测序分析

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lslandgp1972
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背景胰腺导管腺癌(pancreatic ductal carcinoma,PDAC)是一种预后极差的消化系统恶性肿瘤,易出现局部血管侵犯或远处转移,目前缺乏评估患者预后的有效血液标志物。循环肿瘤内皮细胞(circulatingtumor endothelial cells,CTECs)是指从受损的肿瘤血管脱落到循环血液中的成熟内皮细胞,作为评估预后、评价肿瘤血管形成能力及反映药物疗效的指标,已被应用于多种恶性肿瘤,但在胰腺癌中报道较少。此外,由于CTECs在外周血中总量少,难以有效捕获,对CTECs的下游分析存在较大困难。基于二代测序(next-generationsequencing,NGS)的单细胞全外显子组测序技术能够准确地完成全外显子组扩增,获得理想的测序深度,从单个细胞的水平分析肿瘤,在循环稀有细胞如循环肿瘤细胞(circulatingtumorcells,CTCs)的研究中已有应用,而这一技术目前尚未应用于CTECs研究领域。从单个细胞层面探究CTECs的分子特征与关键突变具有重要意义。由于血管形成能力在恶性肿瘤的生长侵袭中起到重要作用,而CTECs是评估肿瘤血管形成的重要指标,探究胰腺癌中血管形成与预后的关系对肿瘤的治疗与评估意义重大。目的1.完成胰腺癌患者外周血中CTECs的检测,并探究其与预后的相关性。2.从单细胞角度探究胰腺癌CTECs的关键突变与分子特点。3.研究肿瘤干细胞特性及血管形成与预后的关系。方法1.使用差相富集-免疫荧光原位杂交技术(subtraction enrichment and immunostaining-fluorescence in situ hybridization,SE-iFISH)对胰腺癌患者外周血的CTECs进行检测,并利用Cox单因素及多因素回归分析、Kaplan-Meier生存分析、Spearman相关性分析等方法分析CTECs及其各亚型与患者临床资料间的关系。2.分离胰腺癌患者单个CTEC、白细胞样本,利用单细胞全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES)的方法对CTEC单细胞样本、原位肿瘤组织石蜡标本与配对的白细胞与配对的进行测序分析,检测样本中的体细胞单核苷酸变异(singlenucleotide variant,SNV)、插入和删失(insertionanddeletion,InDel)、拷贝数变异(copynumber variation,CNV)、突变特征等信息,并利用生物信息学分析的方法寻找高频突变与驱动基因突变。3.对胰腺癌患者原位肿瘤中肿瘤干细胞标志物CD44进行免疫组化(immunohistochemistry,IHC)染色评分并利用 CD31 评估微血管密度(microvascular density,MVD),利用Cox单因素及多因素回归分析、Kaplan-Meier生存分析、Spearman相关性分析等方法分析CD44及MVD与患者预后的关系。结果1.使用SE-iFISH法检测73例PDAC患者术前、术后7天(postoperative day 7,POD7)与术后1月(postoperative month 1,POM1)的外周血CTECs水平。中位随访时间为10.8个月,发现糖尿病病史(P=0.017)、阳性淋巴结数(P<0.017)、术前CD44+CTEC水平(P=0.004)、POM1 CA19-9(P<0.001)是胰腺癌术后DFS的独立预后因素;糖尿病病史(P=0.004)、POM1 CA19-9水平(P=0.026)是胰腺癌术后OS的独立预后因素。2.在4例胰腺癌原位肿瘤石蜡标本与13例CTEC样本中,共检测到131783个SNVs、24809个InDels。原发肿瘤间CNV模式较为一致,而CTECs的CNV模式与原发肿瘤不同,且CTECs间CNV模式异质性较大。全部样本中C>T/G>A突变增加,T>G/A>C突变减少,与COSMIC数据库中突变特征4、突变特征5显著相似。获得TTN、CMYA5、AHNAK 等 1505 个高频突变,PRRC2A、SRCAP、RNF213 等 770 个驱动基因。CD44+CTECs中存在UBR4、TTN、TEP1等特异性高频突变,及CUX1、MYH11、DCTN1等特异性驱动基因突变。3.对39例胰腺癌组织标本进行CD44的免疫组化染色分析,并分析相关临床因素与预后的关系,发现肿瘤直径(P=0.020)、肿瘤分化程度(P=0.010)、CD44染色指数(P<0.001)是胰腺癌DFS的独立预后因素,同时,CD44染色指数(P<0.001)是OS的独立预后因素。CD44表达与肿瘤低分化(Spearman相关系数0.339,P=0.035)、MVD(Spearman 相关系数 0.485,P=0.002)显著相关。结论术前CD44+CTECs是提示胰腺癌术后早期复发的独立预后因素。胰腺癌CTECs与原发肿瘤相比存在较大异质性;突变特征4、突变特征5,以及UBR4、TTN、TEP1等CD44+CTECs中特有的基因可能起重要作用。胰腺癌组织中CD44表达强度与微血管密度显著相关,并且是预后的独立因素。
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