本文分析了目前流域水资源管理体制存在以下问题：体制上分散性不利于实现流域水资源统一管理；缺乏履行职能的手段和实力，没有自主管理权；监督体制的局限性可能导致监督管理制度的失效；经营和管理职能不清，限制了水资源的开发利用和保护；现行水价机制无法适应新的管理体制。针对以上问题，提出了适应21世纪水管理需要的流域管理新体制：流域统一管理更具权威性；管理的内容应涉及水资源的各个领域，较之目前的流域管理内容更为广泛；流域管理机构与行政区域间的事权划分明确，且能有机结合；区域管理应服从流域管理，行业的专业管理应服从流域的综合管理；流域管理机构应该成为流域管理和开发治理的主体，代表国家对流域内的水资源骨干开发项目实施全过程的控制。文章最后针对现行流域管理体制存在的问题，提出了解决问题的对策：建立新型的流域水资源管理机构；坚持流域管理与行政区域管理相结合，加强水资源权属管理；用综合的系统方法对水资源进行管理；建立完善的水权制度体系，制定合理的用水收费标准；建立流域水资源实时监控系统，加大对流域水质水量的动态监测；依法行政，加大法规制度建设。