目的：建立甘肃黄芩水煎液指纹图谱分析方法，测定黄芩苷和黄芩素含量评价药材质量。并对其进行血清药物化学研究，为筛选确定甘肃黄芩的药效成分奠定基础。　　 方法：⑴应用Sunfire C18柱，甲醇和0.85％磷酸水溶液进行梯度洗脱，流速为1mL/min，检测波长280nm，柱温为30℃，建立甘肃黄芩水煎液指纹图谱。⑵在建立甘肃黄芩水煎液高效液相色谱指纹图谱的基础上，通过比较甘肃黄芩水煎液、对照品、含药血清和空白血清的HPLC指纹图谱，确定甘肃黄芩水煎液血中移行成分。　　 结果：⑴精密度、重现性、稳定性试验中共有峰相对峰面积、相对保留时间的RSD均小于3.0％；不同产地甘肃黄芩相似度大于97.0％。黄芩苷和黄芩素的线性范围分别为0.50～1.50μg（R=0.9998）、0.20～1.00μg（R=0.9996），黄芩苷和黄芩素的平均回收率（n=5）分别为97.90％、98.35％，RSD分别为1.12％，0.98％（n=5）。⑵在相同条件下，进行了甘肃黄芩水煎液血清中移行成分的归属研究，通过比较甘肃黄芩水煎液、含药血清和空白血清的HPLC指纹图谱，确定大鼠血中来源于甘肃黄芩水煎液的原形成分及其代谢产物，其中原形成分为1、2、6、7、8号峰。最后，通过对单独给予大鼠黄芩苷对照品进一步确定3、4、5号峰是黄芩苷2号峰的代谢产物。此结果为进一步阐明甘肃黄芩水煎液的药效物质奠定了基础。　　 结论：该方法简便、实用、可靠，可以作为评价甘肃黄芩药材质量及其制剂体外指纹图谱研究的基础。8个入血成分可能成为甘肃黄芩的体内直接作用物质，对其进行深入的研究，将有助阐明甘肃黄芩的药效物质基础及药效机制。