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本研究旨在运用RAPD、微卫星和候选基因SNP分子标记技术,对102只南江黄羊基因组DNA进行标记分析,研究影响南江黄羊生长性状的QTL遗传标记,建立分了标记数据分析统计数学模型,分析标记与生长性能之间的相关关系,为南江黄羊的选种选育提供分子遗传学依据,同时也为其它家畜分子标记研究提供统计学处理方法。论文研究结果如下: 1.RAPD标记与体尺体性状的相关分析 (1) 从10条随机引物中筛选出多态性良好的4条引物,对102只南江黄羊组基因DNA进行RAPD分析,共扩增出明显清晰的标记条带33条,其中多态性条带21条,多态频率58.86%。每个引物扩增条带数在7～9条之间,扩增片断长度在180～2000bp之间,条带分布均匀,分离良好。说明所选引物适于对南江黄羊基因组进行RAPD多态性分析。 (2) RAPD标记分析结果表明,与体重性状显著相关的标记有:A05引物扩增多态条带B和BF条带组合;F09引物扩增多态条带C、F及CF组合;CY0817引物扩增多态条带A和条带F;CY0818引物扩增多态条带A和条带F。上述标记中,A05引物扩增标记条带B、BF组合及F09引物扩增标记条带CF对体重和体尺性状均有显著影响,其它标记条带对体重性状作用显著,但对体尺性状影响不显著。 (3) 各标记条带替代效应对体重性状的贡献率在6.72%～19.26%之间,其中A05-B的替代效应贡献率最高,为19.26%,F09-CF次之,为13.53%,CY0817-A和CY0818-A最低,为6.72%。各标记条带替代效应对体尺性状的贡献率在1.14%～5.81%之间,部分标记与体尺性状呈负相关,但差异不显著。 2.微卫星标记与体重性状的相关分析 (1) 对南江黄羊群体10微卫星位点的遗传参数分析结果表明,微卫星位点的等位基因数在4～16之间,平均等位基因数为8.1个;有效等位基因数在3.84～11.47之间,平均有效等位基因数为6.14个;多态信息含量在0.4611～0.7738之间,平均值为0.5934;微卫星位点杂合度在0.7397～0.9128之间,平均值为0.8203。在10个微卫星位点中,INRA063位点等位基因数最少,为4个;BM1227位点等位基因数最多,为16个。南江黄羊群体含有丰富的微卫星多态信息,适合于微卫星标记分析。 (2) 建立了微卫星与性状间的相关系数的统计学模型,该模型在r_j显著的情况下有以下结论:若r_j>0,说明所研究的性状与该标记的出现与否呈正相关,相关系数越大,说明性状与标记的一致性越强,可用该标记作为所研究性状的辅助选择标记;若r_j<0,说明所研究的性状与