小金海棠MxbZIPIO上游启动子克隆与生物信息学分析

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小金海棠(Malus xiaojinensis)是我国学者发现的第一个抗缺铁苹果树种,是极其重要的苹果种质资源,本文以小金海棠为试材,克隆了转录因子Mxb ZIP10上游启动子,并对该启动子进行了生物信息学分析,主要研究结果如下:1)根据Mxb ZIP10序列在NCBI中查找高度同源序列,通过PCR方法克隆Mxb ZIP10上游启动子,PCR上下游引物分别为GCTATCCACAAACTCCTAAA、AACATATAGACTCTCTCCGC,最终成功克隆到Mxb ZIP10上游启动子1489bp。2)利用CTAB法提取小金海棠DNA,并分别用分光光度法和凝胶电泳对DNA进行检测,结果显示小金海棠DNA在波长为260 nm处吸光度值为0.012,而在280 nm处吸光度值为0.006,260 nm/280 nm值为2,小金海棠DNA浓度为120μg/m L。以小金海棠DNA为模板,通过PCR程序扩增,得到一条约为1500bp的条带,将目的条带DNA回收。回收得到的DNA片段克隆到p GEM-T载体,并转化到已经制备好的超级感受态中进行蓝白筛选。挑阳性克隆培养后提取质粒,T-pro Mxb ZIP10命名。测序结果表明,小金海棠Mxb ZIP10上游启动子包含1489bp碱基序列。3)采用软件plant CARE对Mxb ZIP10上游启动子进行在线分析,该启动子序列中含有核心元件17个TATA-box和12个CAAT-box。另外还包括响应ABA的功能元件ABRE 1个、响应逆境的功能元件HSE 1个、LTR 1以及响应光的功能元件G-box5个等作用元件。综上,小金海棠作为一种重要的铁营养果树资源,研究其吸收铁机制为果树等农作物种植提供基础依据,同时为解决作物生长发育提供理论基础,Mxb ZIP10上游启动子为研究Mxb ZIP10表达调控机制提供了重要基础,具有十分重要的意义。
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