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生物体中很多活性物质都是以多肽的形式存在,多肽涉及人体的激素调节、神经调节、细胞生长和繁殖等各领域。鉴于多肽的重要功能,多肽组学已成为人们科学研究的热点。多肽样品复杂、多样、浓度低,富集过程中易降解、损耗,因此多肽富集和分析方法的优化成为研究多肽功能的关键。石墨烯具有大的比表面积,能更紧密结合目的样品,并可以显著简化样品处理过程。本研究采用石墨烯和传统C18基质两种材料对垂体和海马的多肽进行富集,通过RP-HPLC分析及质谱鉴定,对两种方法的富集效果进行评估。结果显示,石墨烯具有富集多肽的效果,且富集到的亲水性肽段多于疏水性肽段,而反相C18基质偏好于吸附疏水性肽段。可见,就肽段疏水性而言,石墨烯和反相C18基质的富集效果具有互补性,联合使用这两种方法可以提高多肽的鉴定率。用这些鉴定到的多肽去搜索蛋白质,发现有18个蛋白质是由石墨烯和反相C18基质联合使用才能鉴定到;有些蛋白质可分别被这两种方法鉴定到,但是被匹配到的肽段覆盖率在两种方法联用时有所增加,这样的蛋白质垂体样品中有44个,海马样品中有25个。石墨烯和反相C18基质联合使用鉴定到了更多的蛋白质,且增加了鉴定到蛋白质的可信度。精确测量不同状态下生物体表达的蛋白质及蛋白质翻译后修饰的动态变化,已成为探索蛋白质生物功能的手段之一。本部分研究采用18O稳定同位素标记方法结合质谱MRM技术,对大鼠肝再生过程中特异性蛋白质进行定性定量分析。通过合成待测蛋白质的特异性肽段,对其进行18O标记,与复杂样品混合后进行MRM检测。该方法验证了目标蛋白质的存在,得到了其精确含量,为解释一些病理过程提供了事实依据。本研究通过对多肽富集方法及特异性蛋白质定性定量的优化探究,为探究多肽组学研究方法提供了参考,初步分析了小鼠垂体和海马中的多肽、验证了大鼠肝再生过程中功能特异性蛋白质的表达差异,为后续寻找生物样本在生理和病理状态下的差异表达提供了研究思路。