经过二十多年的改革开放，国有企业改革发展取得了显著成就，国有经济总量进一步增加，经济效益、运行质量和竞争能力明显提高，控制力、影响力和带动力进一步增强。国有企业自身快速发展的同时，在落实国家宏观调控政策，保证市场供应，为国民经济持续、快速、健康、协调发展发挥了重要作用，为经济、社会发展做出了积极贡献。在这当中，国有企业负责人起到了极其重要的作用。　　 党中央、国务院对国有企业负责人制度改革非常重视，特别是对负责人业绩评价尤为重视。2003年11月25日，国务院国有资产监督管理委员会颁布了《中央企业负责人经营业绩考核暂行办法》(以下简称《办法》)，2006年12月30日对《办法》进行了修订。应该说，最近几年国有企业负责人业绩评价机制取得了突破性的进展，但仍存在一些问题。如本文所要探讨的关于鼓励国有企业的自主创新问题，虽然《办法》中已经把自主创新的内容加入到对企业负责人奖励的制度中来，但是仍缺乏一套完善评价指标体系。　　 因此，根据新的形势和新的情况要求，必须以科学发展观为主线，对鼓励自主创新的国有企业负责人业绩评价进行深入研究，建立科学、规范的评价方法体系，这是国有企业健康、稳定、持续发展的重要保证，是一项紧迫而十分必要的工作。　　 本文主要分为五个部分：第一部分，提出了研究背景、研究目的和方法；第二部分，系统地研究了自主创新的思想渊源和自主创新理论的形成与发展，回顾了国内外企业负责人业绩评价理论；第三部分，对我国国有企业负责人业绩评价机制的变迁进行了评析，并对现行的评价体系进行了评价。第四部分，以体现国有资产保值增值并实现国有企业自主创新能力的提高为依据，最终构建出了基于自主创新的国有企业负责人业绩评价指标体系。最后一部分以两个公司为例，证实所建体系的可行性。　　 文章的主要创新点是以《中央企业负责人经营业绩考核暂行办法》为依据，从鼓励国有企业自主创新能力的角度探讨国有企业负责人业绩评价机制，并构建了相应的评价指标体系，希望能对国有企业提高自主创新能力提供帮助。